奧薩馬·本·拉丹的出現似乎令北京喜出望外，他們迅速表示同情並主動提出與華盛頓合作，此後兩國關係大大升溫。然而，中國人仍舊擔心，一旦恐怖威脅得到控制，他們有可能再次成為美國敵視的目標。
臺灣是中美關係難題中最為重要的因素。如前文所述，對大陸上的中國人來說，把臺灣置於中國的旗幟下，意味著中國最終重新獲得了在19世紀鴉片戰爭中被西方殖民主義掠去的主權和領土完整。美國對臺灣的支援完全被視為對中國內部事務的干涉。除了美國有意要削弱和遏制中國之外，此舉根本無法解釋。從他們的觀點來看，每當臺灣領導人會見美國領導人，以及每當布什總統說“我們將採取一切必要的措施”來保衛臺灣一類的話時，就是要鼓勵臺灣領導人抵抗中國旨在重新統一的努力，從而給北京的領導層施加更大的壓力，迫使其採取更為強硬的路線。中國人曾對任何願意傾聽的人講過（大多數專家都相信他們的話），有一點幾乎肯定會引起戰爭，那就是臺灣宣佈獨立。美國人認為，中國在臺灣對面增加兵力部署會構成威脅，迫使美國做出反應；而中國人的觀點恰似其翻版。他們認為，除了對美國支援臺灣的姿態所構成的威脅做出反應之外，別無其它選擇。在他們看來，是美國首先製造了臺灣問題，他們將美國對臺灣的支援視為企圖遏制和破壞中國日益提高的國力及影響力這一更大目標的一部分。
這就涉及到中美關係的第二個難題——霸權的爭奪。有位中國教授所說的話，不管真實與否，卻十分說明問題。他評論說，“中國曾經有過150年不幸的歲月，但如今我們復興了。”一旦不可避免的臺灣問題討論過後，中國上層人士心目中的第二個主要話題，就是該國光明的前景以及重返各國前列的問題。不是中國人，你也許無法完全理解上個世紀的憂患給中國人帶來的深深的歷史恥辱感。然而，中國當前的成功所帶來的愉悅和期望感卻很容易感受得到。不過，中國目前也有一種焦慮，他們認為，美國害怕中國成功，並想對其加以限制。
前文所說的美國觀點的翻版又一次在起作用。例如，我們可以回想一下2001年初美國一架EP…3型電子監視飛機在海南島迫降的那次事件。美國人視其為一次無故敵對行為，叫嚷這又一次證明美國為什麼必須當心中國。然而，中國人則問，為什麼美國飛機要不斷在他們的沿海巡邏，故意觸發中國的國防通訊系統以便監視中國的防衛能力？中國指出，他們不僅沒有這樣的飛機，而且也沒有在美國沿海或亞洲周邊國家沿海巡邏。在他們看來，美國從充當霸權大國中獲益，並且謀求保持這種霸權地位，甚至不惜透過強行阻止對手崛起的辦法來達到這一目的。美國的所作所為，當然還有總統在西點軍校的講話，以及其他官員要求進行預防性戰爭及防止任何競爭勢力崛起的言論，大大增強了這種感覺。從北京來看世界，中國人看到了美國在整個太平洋地區部署軍隊和艦隊，將先進的美國武器送往臺灣，美國與俄羅斯緩和關係，因阿富汗衝突之故有史以來第一次在幾個與中國臨界的中亞非民主國家駐紮美軍。他們看到了美國建立國家導彈防禦系統的努力，表面上這是針對北朝鮮一類的“無賴國家”，但也是在消除中國核彈的威懾力；他們看到了美國在沒有聯合國的支援下在伊拉克採取單方面行動；還看到了它那無比先進和強大的軍火庫。所有這些構成了一幅令中國人驚恐的畫面。這一畫面向他們表明，美國人認為他們是威脅。中國堅持說，它過去不是，現在也不是擴張主義大國，除了對美國構成經濟競爭之外，並不構成任何威脅，而經濟競爭美國又說它是歡迎的。實際上，他們是說美國的姿態迫使他們在國防上浪費資源，這些資源他們寧可投入到經濟發展中去。許多人懷疑，美國的威脅是其企圖阻礙中國經濟發展戰略的一部分。
中美關係難題中的第三個因素是自豪、尊嚴、文化撞擊和最終意向。中國人也許是世界上對美國最具矛盾心理的人。如果你在中國的一所大學做一次講座，作為一個美國人，你會受到尖銳的提問，並遭到有關美國霸權主義、軍國主義以及介入臺灣事物的尖銳批評。可是講座結束之後，一半的學生會圍過來詢問他們怎樣去麻省理工學院或斯坦福大學就讀，或者是如何在美國得到一份工作。他們對美國的技術，它的工業和生產力，以及它的民主政府和民主精神都無限迷戀。中國人還發現，美國人與他們自己一樣不拘泥形式、善於表達和易於交談。然而，他們對自己的文化也有極強的自豪感，並深信中國的管理方式必須不同於美國的，但中國的方式必須融入全球化的框架之中。對於美