花嶼位於澎湖群島最西邊，在澎湖島西南30公里處，面積為1.4729平方千米，平均海拔約40米。
花嶼上此時除了倭寇外，是沒有什麼原住民的。
花嶼西北端是山地，東南則是一片起伏綿延的蒼翠丘陵，是澎湖列島最西面的島嶼。
澎湖列島，位於臺灣本島與福建省之間，臺灣海峽中央偏東的位置。
不過此時的臺灣可不是這個名兒，而是叫東番或者小琉球，而琉球群島則被大明稱為大琉球。
澎湖列島之名，是因港外海濤澎湃，港內水靜如湖而得名，由臺灣海峽東南部64個島嶼組成，主要島嶼有澎湖本島、漁翁島和白沙島，面積約為96.6平方千米，佔總面積的76.1%。
面積超過1平方公里的島嶼還有虎井、吉貝、望安等8個，其餘53個島嶼的面積都在1平方公里以下，其中有44個島嶼無人居住。
澎湖的開發歷史，可以追溯到秦漢以前，於宋代已正式收入中國版圖，隸屬福建省泉州府，其開發時間比臺灣本島早380餘年。
元、明時期，隨著移民日益增多，設定了巡檢司，不過大明對此地一直疏於管理，特別是明初倭亂，為了施行海禁，將澎湖人口遷回福建，撤銷了澎湖巡檢司。
直到嘉靖四十二年，為了應對倭寇騷擾，復設澎湖巡檢司，但也沒有真正起到防禦倭寇的作用。
實際上，孤懸海外的島嶼，許多已經沒有了居民居住，島上活躍的大多都是倭寇以及海商。
即便當初曾經遷移過百姓居住，也因此朝廷禁海，島上居民得不到大陸的補給而不得不選擇離開，迴歸大明。
知道了這股倭寇藏身於澎湖列島花嶼的訊息，俞大猷片刻也不能耽擱，當即吩咐平陽縣衙先把人收監，自己則是火速趕回碼頭上船，隨即船隊起航趕赴花嶼。
座船上，俞大猷召集部將吩咐道：“此番大軍分四路包圍澎湖列島，要對澎湖所有島礁進行搜查，務求不放過一個倭寇。”
“是。”
眾將官齊齊應諾。
“大帥，東番島那邊要不要也去看看？上次壕鏡傳回來的訊息，佛郎機人前往倭國貿易時就發現了該島，稱其為福爾摩沙。
東番島距離福建太近，可朝發夕至，而據我們所知，島上並無王權體統，至於無知鄉民存在。
若是東番島被佛郎機人佔據，對我大明似是不利。”
有部將開口說道。
“東番，這個其實福建那邊也大概知道情況，只是礙於大海阻隔，不便派人監管。
就是一個澎湖，泉州府都不願意花精力去管理，更何況偌大一個東番島。”
俞大猷遲疑道。
他的擔心並非無的放矢，實際上明朝上下多少知道開國時的誤會，大琉球確實有所謂的琉球王，還和大明一直保持良好的關係，時不時就會有使節前往大明朝覲。
而小琉球，則根本就是個荒島，島上早年間倒是有福建人遷居過去。
只是海禁以後，人大多已經撤回。
不過，也因此讓大明知道了東番島的情況，島上有一些村落，有土著居住其中。
但是，真正阻止大明軍隊登島的原因，還是明太祖朱元璋在《皇明祖訓》中明確的十五個不徵之國中就有小琉球的名字，也就是此地不納入大明。
朱元璋雖然一生以軍事和政治作為自己的“主業”，但他似乎特別謹慎用兵。
洪武二十年十月，在與諸將論及兵政時，朱元璋這般說道：“國家用兵，猶如醫生用藥。開了大堆的藥，目的是要治病，不能沒什麼病就吃吃藥，那可要吃壞的!
治國也如此，國家不太平，用兵來勘定禍亂。
等天下太平了，只需整修甲兵．操練士卒，備作國防而已。
為什麼這麼說呢?
大家應該要知道：用兵能消除禍亂，但也能招致禍亂，倘若恃富逞強，好大喜功，惹是生非，就會結怨挑釁，這不恰恰招惹了禍亂!
正如醫生亂開瞑眩之藥，強迫無病之人服用，雖然不至於造成身體殘疾或送命，但足以大傷元氣!
所以為國當政者應該常講軍事，但千萬不能窮兵黷武!”
這是一生講究“洪武”、“尚武”的老辣皇帝的“諄諄教導”，這更是朱元璋從歷史經驗教訓中得到的頓悟。
他在南京明皇宮奉天門給各部大臣做了這番告諭：“海外蠻夷之國有為患於中國者，不可