不免有些心痛，但也毫無辦法。最後，雙方在亞歷山大里亞達成協議：奧軍退到明喬河以東地區，河西地區包括堡壘等一切軍事設施全部讓與法軍。雙方還同意在明喬河以西地區設立一個非軍事地帶以隔開法奧兩國兵力，雙方停止敵對行動直到簽訂和約為止。梅拉斯的殘餘部隊平安地撤到了曼圖亞的後方。
梅拉斯的兩個信使先後回到維也納，在剛剛報告了馬倫哥的全勝以後，又送回了慘敗的訊息，奧地利王室和維也納人民先是歡天喜地，繼而又垂頭喪氣，演出了一場引起莫大轟動的鬧劇。
6月17日，拿破崙回到米蘭。這次他受到的歡迎比第一次進入該城時更為熱烈，不論他出現在何處，喝彩聲不絕於耳，米蘭人民歡呼拿破崙為自己的大救星，感謝他把米蘭從奧地利人的枷鎖下解放出來。在這裡，拿破崙見到了馬塞納，對他出色的熱那亞保衛戰大加讚譽，並任命他接替自己任義大利方面軍司令。
為了慶祝馬倫哥戰役的勝利，米蘭組織了一場盛大的音樂會。在這次音樂會上，拿破崙被一位女歌手的豔姿迷住了，她就是格拉西尼夫人。數小時後，義大利的征服者決定要進行一次新的行動。第二天清晨，人們看見格拉西尼夫人已在拿破崙的臥室同這位征服者共進早餐了。接著，貝爾蒂埃接到命令，負責照顧格拉西尼夫人，將她護送到巴黎去。
6月24日，拿破崙從米蘭出發，經蒙塞尼大路返回法國。所到之處，萬眾雲集，歡聲震天。沿途每個城鎮的入口處都豎起了凱旋門，每個鄉鎮都派出一批紳士顯貴前來拜謁，頌揚第一執政的豐功偉績。經過里昂時，歡迎的人們達到了狂熱的程度：居民們傾城出動迎候，第一執政走進人海中，歡呼聲此起彼伏，驚天動地。面對這一切，拿破崙很是得意，一路上談鋒甚健。在行經勃艮第時，他對布里昂說：“再來幾次這樣的勝仗，我也許可以留名後世子孫了。〃〃我在不到兩年內攻佔了開羅、巴黎和米蘭，如果我明天死去，千載之後，我也許能在通史上佔半頁篇幅。”
1800年7月2日凌晨2時，拿破崙一行抵達巴黎。天亮以後，第一執政凱旋歸來的訊息傳遍京城，全體市民湧上大街，爭相看一眼法蘭西的救星和義大利的解放者。夜幕降臨時，無論是家有萬貫的富豪，還是一譬如洗的窮人，無不在宅邸內或草房裡張燈結綵，以示慶賀。誰要是對第一執政稍為表示一點冷淡，都會被群眾認為有保王黨的嫌疑。巴黎人民一致認為馬倫哥戰役的勝利不僅是法蘭西共和國對歐洲反法聯盟的勝利，而且也是新政權對保王黨人的勝利。人們對以拿破崙為首的新政權充滿了美好的希望。
外交勝利與和平馬倫哥戰役以後，拿破崙希望歐洲能夠暫時實現和平。這不僅符合法國的利益，也符合他個人的利益。經過8年的戰爭，法國人民已經厭惡打仗，現在獲得了馬倫哥大捷，這種渴望和平的情緒更加發展起來了；拿破崙剛剛執政半年，地位還很不穩固，在他遠征義大利期間，國內的雅各賓派和保王黨人，一刻也沒有停止推翻執政府的活動。再加上連年戰爭使得國庫空虛，財政惡化，拿破崙決定利用外交手段來尋求與歐洲各國的和平。
拿破崙首先想到的是與俄國改善關係。俄國皇帝保羅一世曾瘋狂地仇視法國革命，他積極參加了第二次反法聯盟。他派蘇沃洛夫將軍率領6萬俄軍進攻義大利，另派一支俄軍進入瑞士，同時又將15000人交付約克公爵用以攻佔荷蘭。這是俄羅斯帝國可供調遣的全部兵力。蘇沃洛夫雖在卡薩諾、特列比亞和諾維等戰役中獲勝，但自蘇黎世戰役以後，在聖哥塔和瑞士各個谷地卻一敗塗地，損失了一半軍隊。1800年蘇沃洛夫回到俄國，軍隊只剩下四分之一。保羅皇帝抱怨奧軍和英軍沒有給他的軍隊以支援，致使其軍隊精銳損失殆盡。
他同時責備維也納內閣在攻佔皮埃蒙特以後不允許撒丁國王復位，毫無崇高寬宏的理想，全然為自己的私利所支配。他也抱怨英國人佔領了馬耳他以後便攫為己有，沒有讓耶路撒冷的聖約翰騎士團復職。俄國與英、奧的不和沒有逃過拿破崙的眼睛，他決心要使這些不和的種子開花結果。
這時在義大利、蘇黎世以及荷蘭，大約有1萬名俄軍士兵當了俘虜。馬倫哥戰役以後，拿破崙向英國和奧國提議交換俘虜，但遭到英奧兩國的拒絕。於是，拿破崙透過外交部長塔列蘭給俄國政府寫了一封信，信的末尾幾句猶如一顆扔向反法聯盟的重型炮彈：法國表示可以立即和無條件地將俄國戰俘連同他們的軍旗送回俄國。這一許諾很快就付諸了行動，被俘的俄國軍官立即領到了他們的佩劍，士兵們都換