餘人圍攻安丘城，眼看就要攻下時，在山東沿海負責防備倭寇的都指揮衛青率兵趕到，使起義軍腹背受敵，最後失敗。地方首領趙琬被俘就義，義軍死傷兩千多人，被俘者四千餘人，皆被明軍所殺，妻小被官府沒收為奴。
唐賽兒領導的這次農民起義，雖然只有60多天的時間，但是擊斃了明朝兩員大將，取得了兩次大捷。在唐賽兒起義失敗後，明朝統治者派柳升指揮軍隊追擊從卸石棚寨突圍的起義軍，把俘獲的起義軍將領全部處死。但是起義軍首領唐賽兒卻已逃走，這使永樂皇帝震怒，下令將柳升下獄，將參議、按察使、布政使以及出現起義各縣的官吏全部處死。為了防止唐賽兒出家為尼，混入道姑行列，永樂皇帝在同年三月和五月下令：“凡北京和山東境內尼及道士悉捕至京師詰問之。”“凡軍民婦女出家為尼及道者，悉關京師。”於是先後有一萬多名尼姑、道姑被逮往京師詰問，但是唐賽兒還是“不知所終”。唐賽兒領