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6月2日，東捻軍攻打唐縣，接著襲擊舞陽、葉縣和臨潁，再向北進，抵達許州。張曜率部橫向攔擊，東捻軍繼續北上，殺向淆川、尉氏和###，這是昔日捻軍十分熟悉的路線。
山東梁山的綠林軍派使者前來迎接任柱與賴汶光。東捻軍晝夜賓士，急行幾百裡，只用了五天時間，於6月11日到達山東鉅野，與山東綠林軍會合，攻破戴廟堤牆，挖爛運河河堤，燒燬駐軍軍營，繳獲各種軍用物資，渡過運河，向東挺進，攻擊泰安，登州、萊州和青州三郡都為之震動。
李鴻章的各路部隊都在南邊，駐防山東的清軍倉促潰逃。自從曾國藩指揮對捻軍作戰以來，運河防衛未曾潰散，而李鴻章接手後有此大潰，輿論大為喧譁，矛頭指向李鴻章。
自從捻軍南下湖北以後，駐防運河的清軍部隊長久鬆懈，加上天旱，河水乾涸，駐防部隊竟然抵擋不住捻軍一天的攻擊。清廷下旨，嚴加斥責。李鴻章連忙從周口移駐歸德，清廷仍然嫌他離前線太遠，他只好又移駐山東濟寧。 。。
1867年，同治六年（5）
東捻軍分兵襲擾寧陽和萊蕪。劉銘傳提議反向防守運河，將運河東岸的長牆移到西岸。又提議防守縱貫山東半島的膠萊河。李鴻章同意採納他的辦法。
劉長佑與英翰也提出一個方略，建議將東捻軍逼到海邊一角，可以收到聚殲的效果。這與劉銘傳的方略不謀而合。清廷下旨，讓曾國藩等人籌辦。
東捻軍這時奔向青石關，從青州奔赴萊州和登州，為清廷實施這個方略提供了便利。只要清廷的軍隊能將東捻軍壓迫到萊膠河以東的萊州灣沿岸，這個計劃就能成功。
膠萊河是元朝至正年間為方便海運所開鑿的海渠，南通黃海，北通渤海，長達三百里，可以連通海運而避開海運的危險。李鴻章徵調各路部隊，集結在青州、萊陽與莒州，企圖將捻軍驅趕到登州和萊陽。
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貴州平壩的綠林軍於5月份向東北方向出擊，攻打貴陽以西五十里處的清鎮。劉嶽昭派謝景春的部隊將綠林軍擊退。
陶新春的起義軍與清軍進行了四個多月的激戰，擊敗了清軍的多次猛攻。岑毓英部將豬拱箐包圍已久，在起義軍中收買叛徒，得到王長毛提供的情報，經過一番謀劃，於6月19日趁起義軍在早晨8點換班吃飯，偷襲豬拱箐營地，搗毀了一百多個柵壘，才逼近山巔紮營，修築壁壘。
陶三春等人衝出重圍，轉移到海馬姑，投奔當地起義軍。
劉嶽昭料定岑毓英所部很快就能攻克豬拱箐，便對平遠的苗民起義軍發起攻擊，以防這裡的起義軍增援豬拱箐。平遠，現在的地圖示為“織金”，在貴陽以西約兩百里處，豬拱箐則在平遠西北方約兩百里處。
岑毓英所部得到劉嶽昭湘軍的援助，於7月份又集中兵力向豬拱箐發起輪番攻擊。
陶新春和張黃蓋督率一萬人出戰，攻破清軍的多座軍營。岑毓英只得親自上陣，率領長沙人楊玉科的部隊衝鋒，將起義軍截為幾段，拋擲火箭，燒燬營棚。這時天降大雨，岑毓英下令撤退。
岑毓英命令部隊捆紮草把，填入濠內，他自己揮戈領先衝鋒，將士們一擁而上。起義軍受驚潰散，一萬多人陣亡或墜下巖澗犧牲。岑毓英命令當地官員呼喊：“投降者免死！”起義軍餘部棄械投降。
岑毓英部攻克豬拱箐，俘虜了四十二歲的起義軍元帥陶新春及另四位首領，押解到黔西城。被俘的其餘三百多名軍官和精壯士卒一千二百多人。岑毓英下令全部處死。清軍遣散五千多名難民，全部發給資金安插。
豬拱箐一戰而平，三省邊界的形勢稍有舒緩。
李瀚章升任湖廣總督以後，劉崐出任湖南巡撫。他奏請撤消周洪印和兆琛的部隊，由席寶田招募新軍攻打起義苗民，開始大動干戈。
清廷經過商議，命令四川和湖南一起出兵，並提供軍餉，要求務必平定貴州。
湖南的鹽茶貨厘稅，自從海口通航，江浙安定，只相當於以前的百分之六十，供給東征湘軍的餉稅也已停徵。為了給新的軍事行動供給軍費，又開始採用老法子，商議如何募捐。布政使李榕提倡應當先令富豪助資，以帶動民眾。但實際操作卻困難重重，引起士民怨恨。大家另找由頭，託言官彈劾李榕所委用的人。由於張自牧長期掌管貴州捐局，大家把矛頭一齊指向他。劉崐上奏辯解，為這些官員在清廷挽回了影響。
已經進入山東腹地的東