省就不得一日安寧。於是他命令李續賓率領全軍包圍九江，分兵駐紮在黃梅、廣濟和蘄州之間，以阻遏江北的太平軍。胡林翼本人則坐鎮武昌排程指揮。
但是，九江是一座堅強的堡壘，見證過湘軍的失敗。塔齊布和羅澤南早已成為故人，九江卻仍然在林啟容手中。湘軍重兵再次到來，勝負未卜。
胡林翼在武昌面對的是一個爛攤子。官衙和民舍已被太平軍焚燒殆盡，萬事都得從頭草創。
胡林翼專心致力於湖北的振興，裁減全省多餘的勇丁，以節約軍費。然後在武漢設立重兵，以鞏固根本。在官員的任免上，他慎重地選擇賢良，制定決策，要求能夠讓百姓休養生息。
胡林翼設立了清查局，查核經過太平軍經營的州縣錢糧。又開設節義局，表彰歷年為清廷殉難的官紳和士女。
當然，胡林翼最重視的是軍需局，這個機構要為湘軍的東征提供武器糧餉。胡林翼規定了三條籌餉的渠道，第一是錢糧，第二是鹽課，第三是貨稅。
湖北的漕政早已凋敝，官民交困，從道光中葉以來，徵收的錢糧還不滿半數。胡林翼三次上奏削減章程，使百姓能夠足額上繳錢糧。
自從淮鹽因戰爭而阻絕以來，湖南和湖北兩省都食用川鹽。胡林翼在宜昌和沙市分設課鹽局，又在武穴和老河口等處推行，課稅比以前的數額有所增加。
胡林翼又仿照劉晏起用士人的方法，在各個市鎮設立分局，催收厘稅，嚴厲杜絕中飽私囊。
從此以後，湖北的軍隊和軍餉都逞強於全國。
胡林翼提綱挈領，鉅細畢舉。他認為百姓造反，是因為法度廢弛，官吏貪贓枉法，百姓偷盜，當局因循苟且，才會有現在這種局面。因此，不鎮壓造反者，就無法堵塞亂流；不考察官吏，就無法清理混亂的源頭。
基於這種考慮，胡林翼參劾鎮道丞守以下幾十名官員，與下屬官員約定，禁止應酬，嚴查跑官，崇尚務實，力戒浮華。於是官員們開始推廉尚能，懂得如何做官了。
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李續賓按照胡林翼的意思將兵力部署停當以後，湘軍水師與陸師開始