直殿局、兵仗局。滿洲近臣與寺人兼用。
較之明朝的十二監、四司、八局，雖少了八個衙門，但重要部門完全保留，所刪除的監、司、局，恰恰正是上諭開頭所謂“不過閽闥灑掃使令之役”，如明朝的“寶鈔司”，如顧名思義，以為印製銀票、錢票之類，那就錯了，一檢《明史？職官志》，會啞然失笑——寶鈔司“掌造粗細草紙”，明宮太監、宮女數萬，太監小解的姿勢與常人殊，亦須用草紙，由於草紙的消耗量特大，所以特設“司”管理製造。又有“混堂司”，職司為“掌汰浴”，俗稱浴池為“混堂”即由此來。如有這些衙門，反而貶低了宦官制度的“尊嚴”，刪之反顯得權重。
於此可知，前面斥宦官，以及後面的告誡，“不許”這個，“不許”那個，完全是杜反對者之口的具文。可注意的是“滿洲近臣與寺人兼用”這句話。自來研清史者，對於十三衙門的興發，頗有申論，但常忽略了這“兼用”的一句話。所謂“滿洲近臣”即上三旗包衣。但上三旗包衣又何肯以太監自居，而況生理、心理及生活習慣不同，亦難共事。我研究上三旗包衣所組織的內務府，發現跟宦官相爭的事實甚多，而合作的跡象極少，一個是順治十八年二月十五日，世祖既崩一月有餘以後，革十三衙門的上諭中，有這樣一段話：“乃知滿洲佟義、內官吳良輔，陰險狡詐，巧售其奸，熒惑欺矇，變易祖宗舊制，倡立十三衙門”；以及最後“吳良輔已經處斬，佟義若存，法亦難貸”。知佟義早已伏法，而此人顯然就是上三旗的包衣，他的職位應該是“乾清宮執事官”，為內十三衙門的首腦；而吳良輔應該是司禮監的秉筆太監。
另一個跡象是，在明詔革十三衙門的同一天，遣送國師玉林南歸，年譜中有“欽差內十三道惜薪司尚公相送”。這尚公當是尚可喜之子。尚可喜有一子名三傑，後來當過內務府大臣；但以年齡而論，可能是尚可喜的次子尚三孝，早期的漢軍，亦算“滿洲近臣”。
至於佟義，是否佟養性一家，不得而知；不過“滿洲近臣”亦可解釋為上三旗的侍衛。但不論侍衛亦好，包衣亦好，都只是為宦官集團所利用。十三衙門透過了乾清宮執事官這條直接上達於帝的途徑，便可挾天子以令諸侯，凡屬於宮中的一切事務，徑取中旨而行。世祖既為一名超級紈絝，亦樂得有這樣一個簡便的指揮系統，予取予攜，盡情揮霍，“經營殿宇，造作器具，務極精工，求為前代後人之所不及”，僅是揮霍一端而已，此外巡幸遊宴，佞佛佈施，漏卮尚多，加以太監從中侵漁，益成不了之局。
按：自漢朝以來，財政制度即有內外之分，國庫自國庫，內府自內府。天子敗家之道有三：一黷武；二巡幸遊觀，土木興作；三佞佛好道。除了用兵須國庫支出以外，二、三兩種靡費，大致皆出於內府，不是太糊塗的皇帝，稍加節制，而又無大征伐，財政上的危機不會太深刻。但看世祖罪己所說，“國用浩繁，兵餉不足，而金花錢糧，盡給宮中之費”云云，則內外不分，揮霍國庫，危亡可以立待；世祖不死，清祚必促。乃一死而局面頓改，此真有天意在內；當然這也是孝莊主持之功，康熙對祖母的純孝，確是有由來的。
《湯若望傳》中有一段說：
順治自這個時期起，愈久愈陷入太監之影響中。這一種下賤人民，當在朝代更替的時期，俱都被驅逐出宮，成千成百地到處漂泊，而這時卻漸漸又被一批一批收入宮中，照舊供職。這樣被收入宮中而又重新紮根築巢的太監，竟有數千名之多。這些人使那些喇嘛僧徒，復行恢復他們舊日的權勢。還要惡劣的，是他們誘引性慾本來就很強烈的皇帝，過一種放縱淫逸生活。
以上敘述，合兩事為一事，乃《湯傳》作者對材料未能充分了解消化所致。所謂兩事，一事即十三衙門設立以後，“重新紮根築巢的太監，竟有數千名之多”，此為順治十年下半年以後的事；另一事即榮親王之薨，對世祖的情緒為一大打擊，“自這個時期起”，即指此而言。榮親王的殯葬，還引發了一場新舊派之間的政治爭鬥。
《湯若望傳》：
關於這位皇子殯葬的情形，在以後繼續數年的歷史中，是我們還不得不屢屢提及的。欽天監內所設之一科，應行按照舊規則，規定殯葬正確地點與吉利之時刻。這一件事情是這一科裡辦理了的，並且還向朝中上有一份呈報。可是這次殯葬儀式是歸滿籍之禮部尚書恩格德之所辦理，他竟敢私自更改殯葬時刻，並且假造欽天監之呈報。於是這位太子便被在一個不順利的時刻裡安葬。這樣便與天運不合了，因此災殃竟要向皇室降臨。這位太子母后的不久崩殂，