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馬斯哈多夫上臺後仍然堅持車臣是獨立國家，同俄的關係應當建立在國際法準則的基礎之上。而俄羅斯則認為，既然雙方已在和平協議中同意“擱置”車臣的地位問題，就應當首先在統一的前提下，解決好車臣的社會經濟問題。因此俄車雙方簽署了一系列經濟合作協議，其中包括恢復車臣居民點的生活保障設施、發放退休金和工資、恢復國民經濟專案等。俄政府還賦予車臣經濟開發特區的地位，實行特殊優惠政策；重新開通了航線、鐵路和公路，並讓車臣地區的石油供應重新歸屬車當局管轄，尤其在出資挽救遭受重創的車臣經濟問題上，俄先後拿出了142億美元。
但對於俄羅斯的“厚意”，車臣卻並不領情。1997年葉利欽與馬斯哈多夫曾兩次會晤，但俄車在統一問題上的談判毫無進展。葉利欽準備再次訪問車臣，但馬斯哈多夫卻稱，葉的訪問“應該嚴格按照國家間相互關係的慣例”和公認的外交準則進行，而不是“視察性”的訪問。同年，馬斯哈多夫還宣佈，車臣語逐漸取代俄語的地位；以俄羅斯人為物件，對所有機關進行大“清理”，“對政府進行根本性變革”；1998年新年開始車臣啟用新身份證，實行新貨幣和更換汽車牌照。
1998年，車臣選舉出為最高統治集團利益服務的新議會，此外還根據馬斯哈多夫的命令成立了最高###教法典法院。該法院自誕生的第一天起就覬覦得到車臣最高立法權力，這也註定了它與議會之間必將衝突不斷。2月3日，馬斯哈多夫發表電視講話，宣佈在車臣全面實行###教法典制度。
同時，車臣還努力加強與外高加索國家的經濟聯絡。其目的有兩個：一是努力同外高加索國家簽署現實可行的經濟協議，以減輕對俄的依賴；二是對車臣無法實施的專案進行談判，力爭從心理上對俄施加壓力。1997年底，車臣副總理阿·扎卡耶夫訪問喬治亞，雙方討論了發揮第比利斯—格羅茲尼公路的作用問題。該公路可使車輛繞過俄羅斯與外界聯絡，從而對打破了俄的封鎖，具有重大戰略意義。車臣還極力擴大與亞塞拜然的聯絡，雙方曾討論車臣石油加工綜合體加工部分裡海石油的問題。車臣還努力求助於西方和###國家。在車臣總統選舉時，馬斯哈多夫就獲取了歐安會35萬美元的資金援助。1997年，馬斯哈多夫先後出訪了土耳其、喬治亞、波蘭、美國等國，他一面積極遊說各國商人到車臣投資，一面尋求這些國家對車臣的政治聲援，聲稱：“如果俄羅斯不第一個承認車臣，那麼其它國家可能首先承認。”
在軍事方面，馬斯哈多夫解散了由杜達耶夫建立的原總統衛隊，組建了車臣國民衛隊、總統衛隊和###衛隊及正規軍等。據專家估計，這支正規軍約有兩萬人。其中包括巴薩耶夫所指揮的“阿布哈茲”空降強擊營；巴拉耶夫的穆斯林營；格拉耶夫的特種兵團；伊薩耶夫的坦克團、高射炮兵團、反坦克團、第一和第二摩托化步兵團、第三步兵團；阿爾薩努卡耶夫的山地步兵團、兩個工程營及兩個通訊營。這一切都預示著車臣戰爭的再次爆發將不可避免。
第二次車臣戰爭（一）
1999年在第一次車臣戰爭中有“高加索狼”之稱的巴薩耶夫不滿足車臣事實上獨立的現狀，要求實現北高加索地區更大的自由。為此他公開叫嚷已經組建了敢死隊，要“解放達吉斯坦”、“解放整個高加索”，並在同年7月4日率領200多名“車獨”武裝分子潛入達吉斯坦進行恐怖活動，偷襲了俄內務部隊哨所，從而點燃了第二次車臣戰爭的導火索。8月7日他又指揮5000多名武裝分子聚集於達吉斯坦和車臣邊境，分兩路攻入達吉斯坦，向俄軍猛烈進攻，企圖繼在車臣趕走俄軍以後再在達吉斯坦打敗俄軍，以實現車臣、達吉斯坦脫離俄羅斯而建立獨立的###原教旨主義國家的目的。
指揮此次行動的34歲的沙米利·巴薩耶夫是車臣前總理，車臣叛亂分子的領導人。他勇猛善戰，因1995年在布傑諾夫斯克的車臣戰爭期間扣押人質而出名。他在總統大選中敗給了馬斯哈多夫，在出任了幾個月的總理之後加入到總統反對派的行列。
面對巴薩耶夫的進攻，8月10日，剛剛成為總理的普京就與總統葉利欽及有關部門領導人討論了車臣形勢。普京表示：“車臣是一個被匪徒和宗教極端分子佔領的地區，是從外部攻擊和內部顛覆（俄羅斯）的前哨陣地”，對車臣匪幫“如果今天不動手；明天損失會更大”。“不管車臣匪徒藏在何處，俄軍都將把他們消滅”。普京請求葉利欽賦予他指揮