在陸上戰場的節節失利，德國最重要的工業區魯爾區被盟軍攻佔，當月德國的鋼產量下降到１９４４年平均月產量的１５％，煤炭產量也下降到１９４４年平均月產量的１６％，德軍軍事工業形勢極其嚴峻，但鄧尼茲仍全力組織Ｚ１型潛艇的生產。
４月，德軍從挪威出動４４艘潛艇前往攻擊英國沿岸海域，擊沉１２艘運輸船，計６。６萬噸、１艘驅逐艦、２艘掃雷艦和１艘武裝拖網漁船，還擊傷４艘運輸船，德軍損失潛艇達２０艘。
其中４月１２日德軍Ｕ－１０２４號潛艇在愛爾蘭海域先後擊沉２艘運輸船後，遭到盟軍第八護航大隊水面艦艇反擊，盟軍護衛艦實施猛烈深彈攻擊，Ｕ－１０２４號遭到重創被迫浮出水面，隨即被盟軍俘獲，雖然後來在拖回基地途中傷重沉沒，但盟軍仍從潛艇上繳獲了一批有價值的機密檔案。
４月１４日由６艘潛艇組成的艇群在北大西洋活動，伺機攻擊同盟國運輸船，被美國海軍發現，美軍認為該艇群的使命是拖帶特殊裝置向美國本土發射Ｖ－２火箭，便立即組織代號為“淚珠”的反潛作戰，在亞速爾群島以北海域投入兩個以護航航母為核心的反潛艦隊，共２艘護航航母和１７艘驅逐艦，在岸基航空兵的大力配合下組成反潛搜尋線，４月１５日和１６日盟軍反潛艦隊克服天氣惡劣的困難，發現並擊沉2 艘潛艇。鴻運高照的Ｕ－８０５號兩次被發現，卻兩次僥倖逃脫了攻擊。
４月２２日，“克羅坦”號護航航母的艦載機擊沉Ｕ－５１８號潛艇，為兩個反潛艦隊的作戰劃上圓滿的句號，當天以“博格”號和“科爾”號護航航母為核心的另兩個反潛艦隊前來換班，盟軍此次參戰兵力更為雄厚，共計２艘護航航母和２２艘驅逐艦。
４月２４日，“博格”號艦載機發現了Ｕ－５４６號潛艇，該艇作困獸之鬥，拼死抵抗，擊沉“戴維斯”號驅逐艦，最終在９艘驅逐艦的圍攻下還是逃脫不了被擊沉的命運。
４月底，鄧尼茲盼望已久的第一艘Ｚ１型潛艇終於建成，由施寧少校為艇長的Ｕ－２５１１號出海參戰，但為時已晚，於事無補。該潛艇是採取分段建造，將潛艇分為八大部件，由３２家工廠製造，１１家工廠進行部件組裝，再由３家工廠總組裝。雖然沒有在戰爭中一顯身手，但在戰後成為美蘇建造常規動力潛艇的樣板，尤其是蘇聯於五十年代建造的Ｗ級和Ｒ級潛艇簡直就是Ｚ１型的翻版。
５月１日，德軍已有９１艘潛艇在海上活動，還有１２艘Ｚ１潛艇完成了戰前訓練，可以投入實戰，從這一趨勢看，德軍潛艇正在慢慢恢復，正如鄧尼茲所期望的，重整旗鼓似乎就要實現了。但是此時，陸地上德國已經失敗了，就在前一天，蘇軍攻克柏林，希特勒自殺，根據他的遺囑，指定由海軍總司令鄧尼茲海軍元帥接任德國元首兼武裝部隊總司令。
５月４日，鄧尼茲下令潛艇部隊停止戰鬥。
５月５日，Ｕ－８５３號潛艇在美國布洛克島附近海域擊沉１艘運輸船，這是德軍潛艇二戰中在美國沿海所取得的最後戰果，該艇不久即被美軍驅逐艦擊沉。
５月６日，歐洲戰區盟軍最高司令艾森豪威爾宣佈歐洲戰場上的所有戰線將在５月８日二十四時前停止一切戰鬥行為。
５月７日，德軍統帥部代表在蘭斯簽署無條件投降書，由於沒有蘇聯代表在場，引起了斯大林的極度憤怒，作為妥協，英美將此次簽署作為草簽儀式。
同一天，英國空軍第二一零中隊的１架“卡塔林那”反潛飛機在挪威卑爾根附近海域擊沉德軍Ｕ－３２０號潛艇，這是二戰中被擊沉的最後１艘德軍潛艇。而德軍Ｕ－２３３６號潛艇在英國福思灣附近海域擊沉２艘運輸船，則是二戰中德軍潛艇取得的最後戰果。
１９４５年１月至５月７日，德軍潛艇共擊沉５４艘運輸船，總噸位約２２。３萬噸，損失潛艇６２艘。
５月８日，德軍統帥部代表凱特爾元帥在柏林近郊的卡爾斯霍斯特向同盟國遞交了由鄧尼茲簽署的無條件投降書，盟軍透過廣播宣佈這一訊息，並要求所有在海上的德軍潛艇浮出水面，報告具體位置並開到指定港口向盟軍投降。
５月９日，第一艘德軍潛艇回到基地，向盟軍投降。在隨後幾天中，先後有１５６艘潛艇返回基地，向盟軍投降。
深受納粹思想薰陶的潛艇部隊官兵，認為鄧尼茲下達的不得破壞武器與自沉軍艦的命令是在受脅迫情況下發出的，並非出自他的真心，何況在德國海軍中，向敵國交出軍艦是有損軍人名譽，加之在１９１９年６月第一次世界大