炮甲板尾艙，外面的船尾還有一層突出艦體的遊廊，也是艦隊司令專屬空間。
天氣好的時候，陳守序會去遊廊透透氣。
炮甲板下是一層多功能甲板，部分士兵住艙、廚房、帆布貯藏室、醫院等都在這一層。再往下一層是彈藥庫和貨倉。
比較特殊是陳守序司令艙的腳下，因為此時馬尼拉大蓋倫還有明顯的舷弧，船尾的層高比船首高出一截，因此在陳守序腳下就有個約佔船長五分之一，多出來的一層。船舵在這裡透過舵柄接入船內。這層還裝備著2門9磅尾炮和4門9磅舷側炮。高海況下，該層的炮門很可能無法開啟。
南海號完成改裝，徹底變成一艘戰艦後。炮甲板單舷有10門大炮，其中4門18磅炮，6門12磅炮。露天甲板單舷7門9磅炮。船頭兩側還有伸出舷外的2門9磅炮。
除了重炮，南海號在艉樓和船艏一共還有14門迴旋炮。
整艘戰艦一共有40門大炮和14門迴旋炮。船上空間很寶貴，除了司令，包括船長在內的軍官吊床都位於大炮上方，平時要與大炮睡在一起。
陳守序掀開分隔士兵和軍官艙的布簾，繞過會議桌、吊床和12磅炮，回到自己的辦公室。身為專職提督的好處，就是他不用像以前一樣帶班了，日常航行中閒暇比較多。為了不浪費這段時間，他會抽空給旗艦和參謀部的軍官們上課，主要是一些數學和自然科學方面的基礎知識。明天主要講三角函式，他還得備課。
辦公桌上點著兩根牛油蠟燭，光線只能說一般。牛油蠟燭是在南美買的，還剩一點存貨。
金城的鯨油儲備已經告罄，現在各船更換船底得使用木焦油為主的黑料。他這次帶梅爾維爾號出征，也有捕鯨的目的。只有一艘捕鯨船肯定不夠，在陳守序離開金城之前，兩艘雙桅縱帆捕鯨船已經在設計之中。像梅爾維爾號一樣，煉油爐也�