世凱滿以為經過如此一番佈置，宋案查不出結果，國民黨領導人之間將互相猜疑，陷於分裂。不僅政黨內閣將化為烏有，從此國民黨也會一蹶不振，不能再和自己為敵了。
然而，事出袁世凱的意料，23日有一個古董商向上海租界捕房報告說：一星期前，他到應夔丞家裡兜售古董字畫，應拿出一張照片來，叫他把照片上的那個人殺掉，許給一千元。他拒絕承擔這件事。今天，他在報上看到宋教仁的照片，正是應叫他暗殺的物件。捕房根據這個線索，當天逮捕了應夔丞，次日正凶武士英也落網，而且從應家中搜出五響手槍一支，應與洪述祖、趙秉鈞往來密電本和函電多件。
訊息傳到北京，袁世凱異常焦急。於3月29日密電程德全說：“連線南方私人來電，宋案牽涉洪述祖，是否確實？究何情節？宜速查復，以憑核辦。”接著，又電催程說：“宋案心煩嘖，亟盼早見證據，望速照迭次電囑，速行檢齊報告。”袁世凱的機要秘書張一也多次密電程，催他把“牽涉中央證據速向英廳索取”，派人帶京呈閱。並特別叮囑“可不作正式報告”，等等。＇2＇由此可以想見袁世凱心慌意亂的情形。
在孫中山和黃興的強烈要求下，程德全被迫於4月26日將查獲的證據向全國公佈，其中最重要的函電有以下各件：
1月14日，