如前定，而且長毛敗退的情況，大致亦在估計之中。因為由於地形的限制，進取的方向，只能順勢而行。左宗棠所部由湖州東南、西南兩方面進逼；蘇軍則由東北、西北分攻，並從正北進扼大錢口，以防長毛竄入太湖。湖州的東面，是東南最富庶的地區，有重兵防守，而且東到海濱，並無出路；在湖州的長毛，唯一的出路，只是向西，如能衝過廣德，則江西有李世賢、汪海洋，都是長毛中有名的悍將，能會合在一起，或者還有苟延殘喘的可能。
戰場如棋局，不但敵我之間，爾虞我詐；就是聯手的一方，亦在鉤心鬥角——李鴻章### 畢竟還是下了一著專為自己打算的棋，將劉銘傳的二十營，陸續拔隊，指向浙皖之交；名為進攻廣德，斷賊歸路，其實是想攔截黃文金，俘『幼逆』，奪輜重。
湖州終於在七月二十六克復了。
如事先所估計的，黃文金果然開湖州西門遁走。大隊長毛分三路西竄，到了廣德，又分兩路，一路向皖南；一路是由黃文金帶著『幼逆』，由寧國過西天目山，經開化、玉山竄入江西境內。劉銘傳窮追不捨；其他各軍為了爭功，亦無不奮勇當先，連追五日五夜，長毛潰不成軍，黃文金死在亂軍之中了。
但是洪福真卻還是下落不明；比較可靠的傳說是由江西南下，打算與竄至廣東、福建邊境的李世賢、汪海洋會合。然後西趨湖北；與『扶王』陳德才聯結，自荊襄西入陝西，在關中另起一個局面。這當然是一把如意算盤。但即令打不成功，這樣竄來竄去，如與安徽、河南的捻匪合流亦是大可憂之事。因此，朝廷對兩次三番，窮追猛打，而竟未能促住『幼逆』，置之於法，深為惱火。
更惱火的是左宗棠。『全浙肅清』的摺子已經拜發，而洪福真未獲，就不能算克竟全功，一時還難望分茅之賞。
辨明瞭『十萬』之說；再論糾參部下的責任，言語晚為犀利∶『至雲杭城全數出竄，未聞糾參，尤不可解。金陵早已合圍，而杭州則並未能合圍也；金陵報』殺賊淨盡『，杭州報「首逆實已竄出」也！』僅是這兩句話，便如老吏斷獄，判定曾國荃有不容賊眾逸出的責任，而曾國藩有謊報軍情的罪過。但在結尾上，卻又筆鋒一轉，故弄狡猾∶『臣因軍事最尚質實，故不得不辯。至此後公事，均仍和衷商辦，臣斷不敢稍存意見，自重衍尤。』這段話是所謂『綿裡針』，看來戒慎謙和；其實稜角森然，句句暗隱著指責曾國藩的意思在內。
這通奏摺發出，不過半個月便有了迴音。由恭王出面的『廷寄』，措詞異常婉轉，不說一時還不能封左宗棠的爵，卻說『左宗棠自入浙以來，克復城隘數十處，肅清全境，厥功甚偉。本欲即加懋賞，恐該督以洪幼逆未滅，必將固辭；一俟餘孽淨盡，即降恩旨。』是很明顯地暗示，左宗棠封爵，不過遲早間事。
關於他與曾國藩的爭辯，亦有溫愉∶『朝廷有功諸臣，不欲苛求細故。該督於洪幼逆之入浙，則據實入告；於其出境則派兵跟追，均屬正辦。所稱此後公事仍與曾國潘和衷商辦，不敢稍存意見，尤得大臣之體。深堪嘉尚。朝廷所望於該督者，至大且遠；該督其益加勉勵，為一代名臣，以副厚望。』上諭中雖未責備曾國藩，但是非好惡，已表現得很清楚。而許左宗棠以『一代名臣』，更是上諭中難得一見的字樣。總之這一場御裁的筆墨官司，左宗棠佔盡上風；而與曾國藩的怨，自然也結得更深了。
曾左結怨，形諸表面的，是口舌之爭；暗中拼命抵拒的，是地盤之爭。而又象在夾縫中受擠，又象首當其衝的是曾國荃。
曾國荃的本職是浙江巡撫。用失之時，為了鼓勵將帥，不按建制任職；此省大員在他省領兵，事所常有。但戰事告一段落，情形就不一樣了。
照常理而論，曾國荃即令破江寧以後有過失，到底百戰功高；應該讓他赴浙江巡撫本任，才是正辦。無奈左宗棠以閩浙總督兼署浙巡，絕無退讓之意。而曾國藩為曾國荃告病，雖由於憂讒畏譏，以急流勇退作明哲保身之計；其實亦是看透了老弟有『妾身不分明』的隱衷，估量他決不能到任，不如自己知趣。
在朝廷卻又能左右為難之苦。一方面東南軍務地穴於湖州克復、全浙肅清，不能不敷衍左宗棠的面子；一方面卻又覺得真個讓簇新的一位伯爵，解甲歸田，不是待功臣之道。因此，對於曾國荃告病，一直採拖延著不作明確的處置；希望曾左之間，能夠消釋嫌怨，言歸於好，由左宗棠出面奏請交卸篆，飭令曾國荃到任。
這是個不能實現的奢望。朝廷看看拖著不是回事，決定成全曾國藩的心願，許曾國荃辭職。可