屠殺的方法是各種各樣的。在西邊的漢中門附近，出現了活埋的情況。
把幾萬人分幾次埋於土中，使他們窒息而死。當時倖存的伍長德，後來站在東京審判的證人席上。在市中心繁華的馬路上，約有一千個人排成一行，被點火焚燒。對逃走的人，就地槍決。在市中心，即現在的人民廣場一帶（鼓樓下面），許多青年被吊在電線杆上，火從下面燒上來，把他們活活燒死。還有許多青年被剝得精光，給澆上硝酸、硫酸後死去（《奪走三十萬人生命的“南京事件”》，載《東風新聞》，一九六七年七月三日。關於在漢中門附近的活埋情況，參照本書第五十九至六十頁）。
一九七一年夏，訪問南京的《朝日新聞》記者本多勝一也聽到過下列可怕的事實：“在‘永利亞化工廠’，反對日本軍強行帶走人的工人，當場被剖開肚子，挖去心肝。據說，後來日本兵把心肝煮熟後吃掉了。”（《中國之旅》，巖波文庫版，第二三一、二三四頁）
這是日本軍對俘虜施加暴行的方法，俘虜當中，有的似乎也被用來作人體實驗的。提交遠東國際軍事審判的。南京地方法院檢察處敵人罪行調查報告》，對此情況介紹說：“敵多摩部隊將我被俘的人帶到醫藥試驗室，把各種有毒細菌注�