，以及剛剛抵滬，加入他幕府的浙江人王大經重算賬簿。。王大經乃舉人出身，早年在皖北參與鎮壓捻軍、太平軍的活動，積功保升至候補道，後在皖北辦團練時長期負責錢餉事務，在財稅方面具有豐富的經驗。
二人翻算賬簿，忙乎了整整一個晚上，從這賬簿中查出了諸多虧空、虛報，數目每月高達四十萬兩之巨。
曾紀澤這回掌握了吳煦貪汙的證據，於是毫不手軟，當即向北京朝廷上奏彈劾吳煦。並在北京方面派來的調查專員抵滬之前，決定暫時與吳煦劃清界線。
曾紀澤以江蘇巡撫的釋出政令：厘捐由於關卡分散，透過的貨物多少不定，很容易滋生弊端，從此改由巡撫衙門親自掌管。所收之稅銀，專供包括淮軍在內的在滬各軍月餉，以及協撥湘軍曾國藩大營之需。
而海關稅因為由洋稅務司徵收，一般不易侵吞，故仍由吳煦經營，由其負責發放駐鎮江的馮子材部清軍餉銀每月3萬兩、中外會防公所經費每月3萬兩，以及江蘇各官廉俸等項。緊接著，曾紀澤對外宣佈，吳煦今後再有虧空，不能歸之於軍餉，巡撫衙門將概不認賬。
曾紀澤本想將吳煦以貪汙之罪當即逮捕，但因其經營蘇滬多年，勢力盤根錯節，相當的龐大。而像他這種地方大員，若在朝廷中沒有人罩著，又怎敢為非作歹。故曾紀澤也不好將吳煦及其黨羽一網打盡，以至於引起江蘇官場的太震動，破壞了目前較為穩定的內部局面。
不過曾紀澤掌握了吳煦虧空的有力證據，同時又有淮軍武裝在背後撐腰，政令一下，吳煦也不敢激烈反對，只好啞巴吃黃連，自認倒黴。
曾紀澤在將厘捐大權收入巡撫衙門之後，立即撤除了閔釗、俞斌等吳煦一黨，委派王大經具體負責“管�