劃部軍的時候，臺灣城以西的海面上出現了十幾艘戰船，一直等候在此地的明軍哨船連忙發出警報，點燃了船上面的烽火，得到警報的臺灣城立即向承天府發出烽火，一時之間明軍各地皆風聲鶴唳，大軍都被驚動。
明軍的水軍主力這個時候已經被劉國軒率領著前去支援金門的明軍去了，在臺灣城和承天府一帶的明軍水面力量這個時候十分薄弱，如果這支船隊是荷蘭人從巴達維亞趕來的援軍的話，那麼明軍這個時候在海上已經阻擋不了荷蘭人奪取制海權和登陸作戰了。
但是從這些船隻的航行速度和船體形態上來看，他們並不像荷蘭人的那種長條形的硬帆船，反而有點嚮明軍或者是清軍水師的福船，明軍哨船壯著膽子靠得近些，發現這些船身上面懸掛著黃底龍驤旗，這時鄭家明軍水軍的軍旗，也就是說這支船隊極有可能是明軍自己人？
這支船隊正是從金門方向而來的明軍，船隊中大部分船隻身上都有作戰時留下的損傷，最前面的一艘船的龍旗甚至被燒糊了一半，褐色的船帆被燻得黑了一大片，船身的右側外舷上面還留下了一個直通船身的彈洞。
船隊上計程車兵士氣低落，這時候遠遠的望見了海平面上出現的陸地，士兵們紛紛走出船艙向東眺望，這支船隊一共有十九艘戰船，都是在金門島被攻陷