局黎城會議決定的建軍方針，對所屬部隊進行了整編，統一編成11個旅、34個團。
8月1日冀南、太行、太嶽行政聯合辦事處（簡稱冀太聯辦）在涉縣東遼城成立。
8月16日向部隊發出《第一二九師關於正太戰役的作戰命令》。
8月20日至9月10日指揮部隊進行了破擊正太路戰役（又稱百團大戰）第一階段作戰。協同晉察冀軍區部隊破毀正太鐵路三分之二以上，攻佔沿線大部分據點。
9月20日寫出《第一二九師百團大戰第一階段戰役總結》。
9月23日至30日指揮部隊進行了百團大戰第二階段榆（社）遼（縣）戰役，攻佔榆遼公路大部分據點，粉碎了日軍利用榆遼公路深入“掃蕩”，蠶食晉冀豫根據地的陰謀。
10月3日對新華社記者發表關於百團大戰的談話，盛讚百團大戰對推進全國特別是華北抗戰的作用及取得的巨大戰果。
10月6日至11月15日指揮部隊進行了百團大戰第三階段反“掃蕩”作戰。其中在關家堖殲滅日軍一個大隊中的400餘人。
第一二九師所屬部隊在百團大戰中共殲日偽軍8000餘人，破壞根據地內外的鐵路、公路共500餘公里，攻克和收復城鎮據點共60餘座，取得了巨大的戰果。
12月寫出《我們怎樣從1940年向1941年邁進》的報告，全面、系統地總結了1940年第一二九師及晉冀豫軍區的作戰與建設情況。
1941年49歲
1月26日參加太行軍區召開的武裝幹部會議，主持制訂了民兵發展計劃和民兵職責條例。
l月31日致電中共中央，請纓南下援助在皖南事變中遭受嚴重損失的新四軍。
l月開辦第一二九師第一期參謀訓練班。
2月1日在太行軍區擴大會上作《關於太行軍區的建設與作戰問題》的報告。
4月15日釋出《第一二九師、太行軍區聯合命令——對軍分割槽建立野戰軍隊管區的指示》，規定太行軍區所屬5個軍分割槽分別隸屬於師和各旅管轄。
5月19日電令太行軍區，為配合晉南國民黨友軍作戰，向洪洞南北側同蒲鐵路進行破擊。
5月24日發出《第一二九師關於強化遊擊集團的命令》，要求各級健全、強化地方武裝與人民武裝相結合的遊擊集團，對敵展開全面全力的鬥爭。
6月4日與鄧小平發出《第一二九師關於乘機開展晉南太嶽中條山局面的指示》。指示太嶽軍區乘國民黨軍隊被日軍逐出中條山的有利時機，迅速派部隊進入其間開闢新的抗日根據地。
6月30日釋出《第一二九師關於遊擊集團的訓令》，明確規定了遊擊集團的組成、作用與指揮系統等問題。
7月7日晉冀魯豫邊區政府成立。原冀太聯辦的轄區增加了魯西33個縣。
8月31日至9月2日指揮部隊進行邢（臺）沙（河）永（年）戰役，攻克敵據點、碉堡60餘座，殲日偽軍1300餘人。挫敗了敵人利用平漢鐵路阻隔太行根據地與冀南根據地的計劃，打通了山地與平原的聯絡。
9月18日第一二九師舉行全師運動大會，檢閱了4個月整軍的成效。
10月31日向部隊發出《策一二九師反對敵人大“掃蕩”的戰術指示》，針對日軍強化政治、經濟、軍事、文化等“總力戰”和採取鐵壁合圍、輾轉電擊、捕捉奇襲等新戰術，指示各部隊結合民兵和人民群眾，發揮遊擊集團的作用，粉碎日軍發動的秋季大“掃蕩”。
10月31日至11月20日指揮部隊進行了秋季反“掃蕩”作戰，共殲敵1300餘人。
12月寫出《第一二九師關於1941年的軍事工作總結報告》，總結了全年的戰況和作戰、隊務、訓練、管理等方面的經驗，提出了新的一年的工作方針。
1942年50歲
1月3日頒發《1942年軍事工作實施綱要》，規定了部隊軍事工作諸方面的工作任務。
1月15日與鄧小平頒發《第一二九師關於實施精兵建設的命令》，要求部隊必須堅決貫徹中共中央關於精兵簡政的指示，並規定了各部隊精簡兵員的任務與辦法。
2月3日至3月3日指揮太行根據地軍民進行了春季反“掃蕩”，殲日偽軍3000餘人，迫敵比原計劃提前一個月結束“掃蕩”。
3月17日釋出《關於武裝工作隊初次到敵佔區工作的指示》，提出了相應的政策要