指導管理，院只成為學校一部分地方的名稱，而非管理校務和機構。文科學長陳獨秀遂於此時離校。學校各學系均設一主任，由各系主任選其中一人為教務長，直接管理教學事宜。各事務單位之上，設一總務長，負責指導一切事務之進行。各教授合組評議會，學校重要事項，提由該會決議。校長室設一秘書，負責與各單位聯絡。北大第一任總務長由蔡校長聘蔣夢麟先生充任，教務長則馬寅初先生當選。前者我離校時仍為蔣先生，後者則馬任職未久即辭去，由何育傑、胡適之、顧孟餘諸先生相繼擔任，顧先生最久，我畢業以後，他尚繼續任職。民十二我畢業後，不悉在何時北大及其他各大學均於教務長之外，又設各院院長，分理各院事宜，且系聘任，與蔡先生當時教授治校之用意，大不相同。
蔡先生於民九冬奉派赴歐美考察教育，於考察期間，其校長職務，由蔣夢麟先生代理。他於十二月底抵法，其後赴比、德、奧、意、瑞士、瑞典、荷蘭、英、美各國考察，於八月中旬代表出席夏威夷太平洋教育會議後返國。在其出國期間，因北洋政府久欠教育經費，各校教職員領不到薪水。向政府請願，反被警衛毆打，因而宣佈罷教；各校學生亦起而聲援。遷延數月，北政府知悉事態嚴重，乃為補發欠薪，並向之表示歉意，各校始復課。蔡先生回國後，大不為然，曾召集北大教職員痛切的說：學校教育青年，教職員應為學生模範，豈可因索薪罷教，貽誤後生？他堅決要求把罷教期間未為學生上課，而領得的薪水，交出歸公。並如認為政府太壞，不能合作，儘可自動辭職，另謀他就。如大家都求去，亦可使政府驚覺反省。豈可既不離職，又不盡教學責任，貽誤青年？教職員接受蔡先生的提示，決議將罷課期間內所領之薪水歸公，但請分期扣除。以後北政府又常欠發學校經費，致扣除之決議，無法實行。但以此可見蔡先生作人處事之嚴正，從此再未發生教職員罷教情事。
蔡先生海外歸來不久，召集學生講話，勉其為國努力。他說：世界大戰結束，人們多謂德、奧、義〈意〉侵略集團失敗後，當實現長期和平。此次他到歐美考察，方覺完全不是那樣。列強們勾心鬥角，均為自己國家利益打算，並未對世界和平著想。我們處此情勢下，非發奮圖強，則無以自全。他歸來後，覺得國人仍將我國的安全，寄望於列強之維持世界和平，而不自求如何鞏固國防。我們的學校對練習軍*，已不注意。他從前買了幾匹馬，教學生學騎術，歸後方知騎術未復學習，連馬都已經賣了。這種誤信世界業經和平的心理，實在太可怕了！望大家務要自行振作，不要將自己國家的安全寄託希望於別國的維護。要國人努力以求自立自強，而後國家方有前途。他本著這種看法，並認為想要國家社會好，自己先應該廉潔持身。乃要求教職員們不要領罷課時期應有的教課薪酬。且屢次呼籲學生們應努力學業，充實自己，以準備為國家效力。民十一五月，北大成立婦孺保衛團。旋聘蔣百里、黃郛兩先生，講授軍事學。
民十一春，學校發生一次不幸騷亂。學校負責人員以為教員講課有指定課本者，有印發講義者；課本系由學生自購，則講義印刷費理應由學生負擔。故決定每學期每一門功課收講義費一元。平均一學期每人負擔不過六、七元，本系無關重要。乃有少數當時所謂“過激派”學生，鼓動拒絕繳納，幷包圍蔣總務長，要求收回成命。蔡先生聞悉，非常震怒，親入重圍，告誡學生不可無理取鬧。學生們多數聞而散去，但仍有一些人鼓譟叫囂。蔡先生乃立即表示辭職。一般學生知悉後，乃決定於翌日上午在大禮堂集會，共商挽留辦法。屆時到會學生踴躍，座無虛席。登臺發言者均主張拘留校長，而坐席的各方面，有人狂喊“下來！下來！噓噓！”不久見發言者不予理會，乃竟欲衝上臺去毆打；致一般學生不平，亦衝上去對打。方看清叫鬧者不過十數人，不敵逃出。下午在原地重行集會，事前宣告系挽留校長會議，不贊同的人毋許參加。到場的人數更為眾多，一致決議挽留校長，並對滋事的學生請學校予以處分。旋學校佈告教授們集會決議，將為首滋事之學生馮某（忘其名）開除學籍。這次校內風潮，由於學生們自動予過激分子以制裁，乃不到兩天，即行平息。學生們警覺這些不良分子與校外陰謀暴亂的黨徒有勾結，乃自動組織許多小團體，從事抵制。我當時加入的一個團體，叫民治主義同志會。其目的在促進*，並防阻過激分子搗亂學校與社會。因絕大多數純潔分子已有警覺，故此後直至我畢業時，本校學生在校內再沒有鬧過風波，而為遏制過激分子搗亂，成立的一些小組織，遂亦無形星散。
在北