任上海，擔任諜報武官。兩年後，岡村寧次調回東京，擔任陸軍第十三師團第六聯隊聯隊長，軍銜也同時晉升為大佐。
1928年5月，岡村寧次率聯隊隨師團開赴青島，與中**隊作戰。’7月，他被調回東京，擔任參謀總部的戰史課課長。1932年2月，他被提升為日軍上海派遣軍副參謀長，曾經作為日方代表，數次來南京同中國外交部談判。幾次見過蔣介石。這年6月，他調往東北，擔任關東軍副參謀長，曾與何應欽商談簽訂《塘沽協定》。1934年，他又調回東京，擔任參謀總部第二部部長，掌管情報工作，主要任務就是專門蒐集有關中國的軍事、政治情況，研究和制定對華政策。到職不到兩個月，就以商人身份秘密到中國，以旅遊為藉口，在瀋陽、大連、旅順、北京轉悠，尤其在南京住了兩個月。目的是透過和中國人交朋友，瞭解中國的軍事情報。何應欽留日讀書時，岡村寧次是他的老師，關係相當密切。他在何應欽家住了一段時間，學會了燒中國菜，特別喜歡吃千張結紅燒肉。據他在日記中透露，他一次能吃一斤千張結紅燒肉。然後，他又到廣州，多次拜訪廣東軍閥陳濟棠，有時李宗仁也陪著交談。岡村寧次遇到情緒好的時候，邀請陳、李二人上飯店喝酒，在交杯換盞、笑談風月中搜集了大量關於蔣介石的情報。由於蒐集情報有功，他被破格提升為中將第二師團長。這個職務非同一般，因為那時整個陸軍總共才有17個正規師團。
1937年4月，他率第二師團來東北作戰。鎮壓當地的抗日武裝。1938年6月30日，他被提升為第十一軍軍長。也就在這一天，他回東京拜謁天皇，受領了御賜神酒和賞金，接受了進攻武漢的使命。
7月12日，岡村寧次率領新組建的第十一軍司令部人員在上海登陸。15日到達南京，向煙俊六報到。煙俊六向他介紹了日軍下一步作戰進攻武漢的方案，目的是除繼續尋殲中**隊主力之外，還有一個重要的政治因素，就是南京淪陷後，國民政府迂都重慶，而蔣介石在武漢，軍事委員會在武漢，中國當時的政治經濟軍事中心在武漢。日本政府認為，只要佔領武漢，便可事實上摧毀國民政府。至少把它趕到西南一隅，降至“地方政府”的地位，有利於引誘國民黨內部的親日派出來與日本合作，重新建立一個聽命於它的中國政府。
這年年底，汪精衛果然逃出了重慶，投進了日本的懷抱。另外，選擇武漢作為下一步作戰目標，是因為武漢在長江邊，便於舉行海陸空三軍立體作戰，能充分發揮日本戰艦的威力，也便於沿長江水路對大部隊進行後勤補給。也就是說，糧食、彈藥在日本長崎上了船，幾天工夫就可以直接到達武漢。
煙俊六還向他介紹，投入武漢戰役的日本陸海空軍近40萬官兵，同時，大本營為配合武漢作戰，向中國增兵40萬，增撥作戰費用32。5億曰元。
煙俊六介紹完情況，拍拍岡村寧次的肩膀說：“進攻武漢說起來兩個軍，第二軍從合肥經大別山向武漢進攻，繞道走遠路，途中必然遇到中**隊的阻擊。走大別山的這一路行軍步子慢，我不指望他們有多大貢獻，我的意圖是牽制中國人的兵力，進攻武漢的實際操刀手是你，希望你不辜負天皇對你的信任。’
岡村寧次說話謹慎，沒有拍胸脯下保證，只是聳聳肩說道：“讓我試試吧，不行另請高明。”
其實，在他的內心深處，雖然知道中**隊在武漢有120個師，110餘萬兵力，相當於進攻武漢日軍兵力的三倍。而且，武漢外圍地形惡劣，加上天氣炎熱，這一仗不是好打的。可是，不可一世的他，根本不把中**隊放在眼裡，他有必勝的信念。
幾天以後，岡村寧次來到彭澤，他先用一週時間熟悉雙方情況和地形，爾後又用一週時間制定作戰計劃，他準備起用波田支隊作為進攻九江的尖刀部隊。
波田支隊的實力相當於日軍的一個旅團，而支隊長波田重一的軍銜卻比一般旅團長的少將銜還高一級，他是中將支隊長。波田支隊的成員大部分是臺灣人。甲午戰爭後，中國在黃海大戰中敗在日本人手裡，美麗的寶島割讓給了日本，臺灣成了日本的“領土”，臺灣人也威了天皇的“臣民”，許多臺灣人起了日本名字，波田支隊的官兵習慣了臺灣的亞熱帶氣候，武漢又是出了名的火爐。因此，岡村寧次認為，選擇波田支隊進攻武漢，是最理想的選擇。
岡村寧次同波田倆人密商了三天，決定對九江採取偷襲。
7月22日晚上，大約**點鐘時，夜色如墨，微微細風，九江城內的第二兵團指揮部