1684年3月25日，幾艘隸屬於臺灣銀行的船隻突然開進了閩江入海口附近。正在此巡弋的一艘福建水手戰船——“雅克薩”級武裝運輸艦，無蒸汽推進系統版本——立刻靠了過去，小心翼翼地詢問起了他們的來意。
雖然面前總計六艘艦船（兩艘“星”級輕巡洋艦、四艘“雅克薩”級武裝運輸艦）讓他們感到有些不安，不過福建水師多年來的底蘊給了他們莫大的信心，堅決上前詢問了起來——即便經過多年的所謂“正規化建設”，福建水師依然沒有拋棄自己的傳家寶，即數量龐大的小船隊伍。
這些小船，多是中國近海常見的船型，噸位不大，數量眾多，在福建近海的淺水區域如魚得水，是一股非常龐大的力量。明末鄭芝龍將這些或是漁民、或是海商、或是海盜的小船組織起來，一度縱橫南海，罕逢敵手。即便如日中天的荷蘭東印度公司，當時也不願意在福建近海的淺水區域與其作戰（有點類似英荷海戰中英國船隻不敢到淺水區域與荷蘭小船作戰一般），可見其實力之強大。
鄭芝龍憑藉這個龐大的船隊打敗了競爭者劉香，壟斷了南中國海的貿易，無論是荷蘭人還是英國人，如果不想徹底得罪鄭氏集團從而導致拿不到貨的話，還是老老實實給他們繳稅比較划算。毫無疑問，這種貿易的壟斷反過來又極大滋潤了鄭氏集團，使得其力量更加增強，甚至從海上延伸到了陸地，成了福建事實上的土霸王。
福建水師力量第一次受到重挫是鄭芝龍降清。去了北京後的他水師群龍無首，平日裡養起來的海盜、漁民們因為沒人發錢了而散去了很多，再加上也有不少人對其降清不滿，因此原本嘯聚一塊的福建水師頓時星散各處，再也不成規模。這從後來其子鄭成功回福建招募舊部就能看得出來，前來投奔的人並不多，遠不及當日鼎盛時期的規模。這固然有彼時鄭成功財力不足的原因，同時也有很多人歸隱、散去有關。
好在鄭成功嘔心瀝血經營多年，再加上抗清旗幟給他帶來的光環加成，福建水師的實力又慢慢有所恢復，但與當初也有所不同。其中，最大的區別就是數量減少了很多，即原本鄭芝龍時期數量龐大、型號雜亂的漁船、貨船什麼的都被剔除出了水師隊伍，鄭氏集團也不再給他們發放賞賜或津貼，軍民分離執行得非常堅決。
取代這些船隻的，是鄭成功設在馬尾的造船廠仿造的一艘艘專業戰船（看來無論是東西方，專業戰艦和武裝商船的逐漸分離都是大勢所趨）。這些戰船說實話技術並不怎麼先進，但可以看得出來努力吸收了許多西洋帆船的技術特點，噸位也一般，火力馬馬虎虎，但專業戰艦就是專業戰艦，不是他老子時期那些亂七八糟的雜號小船可比的。唯一的缺點，大概就是養船、養兵的費用比較高了，畢竟這是正規軍了，平日裡要訓練、要發餉，不像他老子鄭芝龍時期，平日裡除少數核心艦船有餉銀外，大部分小船上的水手都是靠捕魚、運貨為生，只有徵召時才會有一些賞賜發下，兩者的維持成本完全不是一回事。
當然鄭氏也知道自己的造船水平有很大侷限，中國風格的船隻船底較平，吃水淺，風範操作不便，不利於深海航行，因此多年來鄭成功及鄭經父子也一直在努力蒐羅西洋技師幫他們造船，並吸收他們的造船思想，這些人部分來自兩家東印度公司，部分來自當年東葡戰爭時期從澳門城流散出來的，水平還算可以，有效提升了鄭氏集團的造船水平。
此外鄭氏也透過幾次難得的機會，從東岸人那裡進口了多艘“雅克薩”級武裝運輸艦。這款由黑水造船廠設計的經典船型非常適合遠東地區的海況，航速也較快，可以拿來做戰艦，也可以做商船，用途較廣，鄭氏目前已在馬尾造船廠內進行仿製，據說進度還不錯。
從這裡就可以看出，福建水師的力量其實是頗為不弱的，而且還能持續性補充，這就很令人警惕了。南方保安司令部曾經根據手頭的資訊，仔細評估過福建水師的戰鬥力，最後得出其整體實力可能還高於東岸人的第三艦隊鄂霍茨克海分艦隊，因為其船隻數量眾多，水手數量也是東岸人的十倍以上。不過保安司令部的海軍參謀們同樣認為，兩軍若真槍實彈地打起來的話，紙面力量佔優的福建水師應該無法佔據優勢，會在與東岸海軍分艦隊的交鋒中遭受巨大損失。
究其原因，主要還是東岸船隻效能比較出色：船隻速度快、火力猛，有蒸汽動力加成，人員訓練水平也較高，船隻適應性也好，打起來的話，只要東岸船隻不陷入福建水師的包圍之中，那麼依靠出眾的船隻效能還是能夠打贏海戰的。
當然雙方還沒有走到