日凌晨2：30
怒龍軍組織透過網際網路向全世界發表宣告，表示對襲擊靖國神社事件負責，並警告日本當局不得干涉中國統一大業。如果日本與中國為敵，怒龍軍將採取更加猛烈的手段對日本進行攻擊。
12月6日上午9：00
日本東京十萬市民舉行大遊行，抗議恐怖主義襲擊。
東京都知事石原慎太郎發表電視直播講話，強烈譴責中國恐怖分子在靖國神社造成的血案，對12。3事件中遇難的軍警及平民表示最沉痛的哀悼。
石原都知事認為，一個強大而充滿了反日情結的中國是對日本最大的威脅，目前所發生的事情已經證明了這一點，日本要學會對中國說不，應該拿出更強硬的外交和經濟政策向中國政府施壓，敦促其全力打擊國內的國際恐怖集團，並儘快緝捕從日本潛逃回去的怒龍軍破壞分子。同時呼籲日本國民自覺監視身邊的可疑華人，及時的向警方提供可疑線索，全民行動起來，與滲入境內的反日華人恐怖集團作鬥爭。
石原講話一小時後，日本全國各地掀起了針對華人華僑和留學生的暴力活動，出乎意料之外的是，受到襲擊的中國人及華人社團對此進行了殊死抵抗，在東京，神戶等大城市，甚至有些中國留學生公然紮起“我是中國人”的頭帶，高呼支援怒龍軍的口號，手持鐵棍鋼管與右翼團伙對峙，日本警方不得不出動大批警力將某些街區封鎖，阻止雙方可能進行的大規模流血衝突。
世界各主要國家外交部及政府首腦對東亞出現的緊張局勢紛紛發表講話，表示擔憂，並希望有關國家保持克制和合作，全力打擊恐怖主義，保持本地區的穩定與和平。
同日
東南亞，港澳，韓國，朝鮮等地數十萬群眾大遊行，歡慶日本軍國主義老巢靖國神社被摧毀。臺灣各地也出現大規模群眾遊行，對靖國神社的被毀拍手稱快。
中國內地
各大城市鞭炮齊鳴，上百萬市民自發走上街頭，群情激昂，打著反日愛國標語，舉行大遊行。
國外媒體紛紛指出，在市場經濟條件下，中國民眾這種空前高漲的民族主義情緒大爆發，非常令人吃驚，有關專家人士對這種現象百思不得其解。
12月7日上午7：30
國務院下發緊急通知，要求各省市政府職能部門密切關注當前形勢，採取一切必要手段，確保當地社會治安的穩定，以及正常的生產，工作秩序。
12月8日下午至晚間
上海，南京，瀋陽，北京等大城市學生，工人，手工業者再次自發的舉行大規模示威遊行，抗議在日本正在發生的迫害華人華僑的行徑。學生代表向政府遞交民意書，希望中央政府能夠表明立場，支援群眾的愛國行為，積極與日方交涉，切實維護旅日華人華僑的生命及財產安全。
網際網路上連續數日展開中日駭客大戰，雙方被攻擊網站損失慘重。
同日晚20：10
國務院再次下發緊急通知，要求各地黨政機關在保護民眾愛國主義熱情的前提下對遊行群眾進行積極引導和說服教育工作，通知同時要求，各大高校和廠礦企事業單位要對所屬人員加強管理，嚴肅校紀廠規，工人影響生產要下崗，學生影響教學要給予記過處分，應屆畢業生暫扣畢業證書。
12月9日上午，中新社發表頭條新聞，披露靖國神社被炸後，民國總統陳水扁曾打電話向日本首相小泉表示深切慰問，訊息傳出，臺北市上千群眾手持棍棒和大幅反日標語牌圍攻總統府，陳水扁在一片罵聲中發表電視講話，堅決否認曾打電話給日本首相表示慰問一事，並呼籲百姓保持冷靜，不要上了別有用心人的當。
同日下午
上海，南京，瀋陽等地日本駐華大使館受圍攻，示威群眾與維持秩序的警方發生衝突，數十名警察和市民受傷，上百市民被捕。
在日本
華人與日本右翼團伙的衝突仍在進行，日本警方起初出動大批警力，拘捕雙方人員數百人。至下午16：00左右，日本黑社會暴力團介入衝突，警方在高層授意下采取避讓政策，華人社群和產業慘遭打砸，在東京，當天有近百名華人華僑在和暴力團伙對抗中喪生或受傷。另有大批中國女留學生、研修生被日本武裝暴徒肆意強暴凌辱。
12月9日晚
中央電視臺發表重要社論：保持安定團結，愛國熱情要有度——警惕一小撮壞人藉機興風作浪。
12月10日晨，中國各大城市街頭出現防暴警察，在各地黨