癇風患者是“活人死腦袋”的事實，證明“靈
機記性在腦”的科學論斷。王清任特別引用了李時珍“腦為元神之府”的觀
點，作為自己的論據。他們都把“元神”看作高階中樞神經機能。“腦為元
神之府”，即肯定腦是高階中樞神經活動的司令部。在中國學術史上，推翻
了幾千來“心之官則思”的傳統觀念。
《本草綱目》中儲存的李時珍的醫案、醫話，是他多年研究醫藥學的心
血的結晶，無一不是醫學理論與臨證實踐相結合的產物。這是醫聖李時珍留
給人民的一筆珍貴的醫學文化遺產，可傳之永久，受用無窮。
三、《命門考》與《三焦客難》
李時珍對醫學理論的另一貢獻，是創立腎間命門說，寫了《命門考》、
《三焦客難》，可惜二書均已失傳，《本草綱目》中儲存了關於這一學說的
部分觀點。
命門，是中醫學的特殊觀念，被認為是主宰人體生理功能的一種實體，
對維持生命具有極端重要作用。李時珍稱它為“生命之原”。這種實體的形
質如何？居於人體哪一部位？言人人殊。歷代醫家認為，命門同腎是相同實
體，人有二腎。左謂之腎，右謂之命門。首創此說者為《難經》。《難經》
指出：“命門者，諸精神之所舍，原氣之所繫也。故男子以藏精，女子以系
胞。”表明它十分重要。同時提出“左腎右命門”的說法：謂“兩腎者，非
皆腎也。其左者為腎，右者為命門。”對於這一說法，隋代楊上善註釋《內
經》時加以重申，在宋以前，一直視為定論。宋元時期，醫家亦沿用此說，
《太平聖惠方》寫道：“夫腎臟者，足少陰之經，左側為腎，右為命門。”
在醫學史上，第一個推翻這一傳統觀點而創立新說的就是李時珍。他對命門
作出新的解釋，認為命門並不是右腎。首創“腎間命門說”，認為命門實是
兩腎之間的另一實體。其位置在人體脊椎自下向上數的第七節之旁。他說，
命門“其體非脂、非肉，白膜裹之。在七節之旁，兩腎之間。”對命門的形
質和部位，第一次作出新的判斷。
李時珍申述命門的極端重要性，指出：命門繫於脊，“下通二腎，上通
心肺，貫屬於腦。為生命之原，相火之主，精氣之府，人物皆有之，生人生
物，皆由此出。”（《胡桃·發明》，校點本第三冊，第1804 頁）
李時珍關於命門的考訂，從以上文獻可以歸納為四個基本觀點：第一，
命門非即右腎，而是另一實體，這種實體非脂非肉，白膜裹之。第二，命門
的位置，在七節之旁，二腎之間。第三，命門同其他臟腑的關係，二系著脊，
下通二腎，上通心肺，貫屬於腦，是三焦的本原。第四，命門的功能。為生
命之原，精氣之府。從此命門學說更為醫家所重視。
命門和三焦具有體用關係，更是李時珍的創造性見解。基本觀點可從《本
草綱目》窺見。
命門同三焦的關係，歷代醫家少有專門論述，更未強調認識這種關係對
發展中醫的重要性。李時珍在弄清命門的功能和它與其他臟腑的關係後，專
門寫了《三焦客難》一書。從書名不難想象他採取《內經》中黃帝和歧伯等
對話的方式，自設賓主，系統地論述了自己關於三焦的全部觀點。《本草綱
目·序例》中《臟腑虛實標本用藥式》一文，反映了李時珍對命門、三焦的
基本論斷，“命門，為相火之原，天地之始，藏精生血；降則為漏，升則為
鉛，主三焦元氣。”“三焦，為相火之用，分佈命門元氣，主升降出入，遊
行天地之間，總領五臟六腑、營衛經絡、內外上下左右之氣，號中清之府。
上主納，中主化，下主出。”這兩段論述把命門、三焦在人體生命活動中的
重要地位及其作用，以及三焦同命門的相互關係講得十分清楚。《胡桃·發
明》中，李時珍對命門與三焦的關係更有概括性論述：“三焦者，元氣之別
使；命門者，三焦之本原，蓋一原一委也。命門指