雖然白文選投降了，還殺了潘獨驁以求保命，但重慶城內的零星戰鬥，依然持續了整整一天才結束。
畢竟大軍亂戰，尤其是進入巷戰之後，哪裡還能有指揮中樞可言，主將投降的訊息，也未必能很快傳達到各自為戰的部隊耳中。
有些都尉、掌旅級別的流賊軍官，就算聽到官軍宣佈白文選已降、逼迫他們立刻放下武器，他們也會以為是兵不厭詐的謊言。
除非是白文選本人被綁著每一處陣地一個個跑過來喊話，他們才信，而這都需要時間。
到了正月初七早上，重慶城內才處處餘煙漸散。
控制住局勢後，官軍也清點了一下城內人口和破壞情況，這才確認幾乎沒有什麼良民百姓活下來，被張獻忠留下的，果然都是願意從賊的新兵壯丁。
二十多萬人近三十萬，就這麼被張獻忠徹底屠盡洗劫，才拿出那麼多錢財滾雪球擴軍。
（注：歷史上張獻忠屠武昌、重慶、成都這幾個個案都是明確史實，不需要蝴蝶效應來造成，也不需要黑。
但是說張獻忠屠盡四川，那是有水分也有點黑的，具體張獻忠和清軍各屠多少比例無法考證，說各殺了一小半到一大半的都有，我就不貿然下結論了。但上述這幾個大城市一進城就被全面屠是板上釘釘的。）
情況這麼複雜，朱樹人也只好對投降的部隊分情況處置。
首先，很多人手上都是沾染了無辜鮮血的，數量還不少，有些還是多次屠城，這種部隊要直接編入官軍，那絕對是不行的。
哪怕是當炮灰敢死營，在後續戰鬥中拿去衝張獻忠的陣營，鬼知道會不會再次臨陣倒戈。
所以倉促之下，朱樹人也只能快刀斬亂麻地定了幾條劃線原則。
先把所有人都關起來，暫時放入苦役營，慢慢甄別。
對於四川本地剛剛被裹挾的，可以看看有沒有什麼劣跡，如果只是為了活命，而且身體也還健康並不虛弱，那就可以在短時間的改造後，先編入方國安的部隊。
當然，也包括方國安手下的王光昌、王光興，和秦良玉麾下的譚文等人。
如果是四川本地新兵，但被指認原本就是地皮流氓山賊，那隻能是進行軍事化管理屯墾，恢復生產，不能發給武器。
另外，這些四川人都是被搶的物件，官軍來了之後，直接發還被搶財產是不可能了，也沒法計算，容易出現假賬混亂。所以就統一從戰利品裡拿出一份，作為重新從良的安家費即可，每人發幾石糧食度過寒冬和春荒，再留點作為春耕的種子。
這些本地人相對還算好安排，張獻忠軍裡的老營，才需要慎重處置。
朱樹人本不想以地域來劃分危險性，但時局如此，他也沒辦法，就先簡單一刀切，按照從賊年限，按陝西老營和河南老營來區分。
對於跟著張獻忠七八年以上的陝西人，那肯定是不能編入部隊的，全部先罰為最重的苦役，嚴加看管，這部分人太危險了。以後就算要作為敢死營，也要等韃子入關，跟清軍打仗的時候，再把這些人放出去打最危險的戰鬥，活著回來才能漸漸免除罪責。
河南老營一般從軍最多五六年，湖廣兵更少，可以酌情在後續的平定流賊戰鬥中，就逐步作為敢死營淘汰甄別。
最後，朱樹人還從那些陝西老賊裡面，讓俘虜互相指認，挑選出一些罪大惡極，比如多次積極參與屠城劫掠的，處斬了大約數百人。
而想要立刻重新拿起武器免除苦役營懲罰的河南湖廣降兵，必須參與行刑，由他們動刀捅那些被判處斬殺的陝西老賊，每人捅一刀就行，也不需要直接捅死，見血就行。
畢竟朱樹人也不能對投降的部隊大開殺戒，總共就那麼幾百個該判死刑的，而需要納投名狀的降兵足有成千上萬，根本就不夠砍。
納了投名狀之後，朱樹人當然也會主動對外宣傳，他的降兵都是納了投名狀的，如此一旦訊息將來傳到張獻忠耳朵裡，他手下的陝西老賊們就會跟這些河南湖廣叛徒產生仇恨，河南湖廣叛徒也就沒那麼輕易敢再動搖投回去。
當然了，這種小把戲具體有多大效果，實在是存疑，但有總比沒有好，也是事急從權。
……
花了兩天在重慶整頓完後方，也從奉節又運來一批軍糧到重慶囤積好，確保後續進攻的物質基礎後，朱樹人也差不多該重新開拔西進了。
與此同時，就在這兩天裡，留在湖廣後方負責監軍的王公公，以及新任四川巡撫方孔炤一家，也都倉促趕來