下一步供應藥材的基地保留了。
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杜淹在京城還有幾家米行和倉庫，也全部保留，用來儲存和變賣糧食。
在醫館的取名上出了一點小麻煩，左少陽讓大家出主意，因為各地要設立分館，所以京城總部的叫某醫館總館，各地的以州縣命名，叫某醫館某州縣分館，這個沒問題，但是，具體醫館該叫什麼名字，眾說不一，馬周提出叫“黎民醫館”，侯普說就叫“百姓醫館”，杜敬說叫“白丁醫館”；因為老百姓都戴黑色頭巾，所以吉運算元建議叫“黔首醫館”；杜帳房更是直截了當，建議叫“草民醫館”。
左少陽覺得都不好，突然想起文革的時候鄉村醫生的稱呼“赤腳醫生”，靈機一動，道：“乾脆就叫‘赤腳醫館’好了，咱們將來不僅要在城裡坐著等貧窮百姓上門求醫，還要走村串寨到田間地頭去給老百姓送醫送藥突出一點，那就是用腳底板走路，服務老百姓”
雖然馬周等文人覺得有些土，但是，本來就是服務百姓的，百姓能看得懂就行，而且這樣個親切，比白丁、草民之類的帶有一些輕賤的稱呼要強得多。所以，都贊成用這個名字。杜敬和杜帳房雖然覺得太直白太土氣，但也沒有提出異議，因為這個稱呼是會長提出的，不好多說什麼。
名稱定下來了，京城的總部叫做“赤腳醫館總館”，其餘兩個分屬東西的醫館叫“赤腳醫館東南分館”和“赤腳醫館西南分館”。將來各地州縣設立的，也以此命名，比如合州的就叫“赤腳醫館合州分館”等等，而專門負責藥材供應的就叫“赤腳醫館東市藥行”之類的。
接著任命三個醫館的掌櫃，總館掌櫃由醫舉榜眼邱一壺擔任。邱一壺當了個散官，閒居在家，已經聯絡他了，他願意到基金會做事。
另外兩個醫館的掌櫃，經過與孫思邈和許宗商議，分別聘請孫思邈的兩個徒弟守志子和許宗的徒弟盧林擔任。這兩人也是京城名醫，一直在孫思邈和許宗的醫館坐堂，不僅醫術高明，而且為人穩重，沉著老練，通達事故。
東市西市兩個藥行，還有幾家米行的掌櫃，則全部撤換，由祝藥櫃推薦的兩個人選，以及瞿老爺子推薦的人選擔任，都是多年從事藥材和糧食生意的老行家，是信得過的人。
商定之後，許宗建議，杜淹拿出這麼一大筆鉅額資金辦這個濟民的醫館，現在他不當官了，能否也給他一個職務。
左少陽表示，如果他辭官成功，不當官了，就任命他為名譽會長，對外代表醫館從事一些協調各地衙門，接待來訪等禮儀工作。
可是，事與願違，隨後幾天裡，傳來的訊息卻是，杜淹的辭職被皇上否決了，皇上只讓他安心養病，不同意他的辭職。
當杜寅一臉惶恐地將這個訊息報告左少陽，並一再發誓說父親杜淹絕對是真心誠意請辭，只是皇上堅決不許，所以父親實在沒辦法。還請左少陽諒解。
左少陽已經預料到了這個結果，請孫思邈進行核實，回來告訴左少陽，的確是這樣，杜淹的確打了一份長長的辭職奏摺，但是皇上沒有批准。至於其中杜淹是否搞鬼了，不得而知。不過孫思邈問了皇上，皇上的確表示國家社稷還需要杜淹出力，現在還不能讓他退隱。看來至少皇上那裡表面上是不讓杜淹辭職的。
左少陽又請孫思邈去大理寺打聽一下杜淹案件的進展，反饋的訊息是進展緩慢，截至目前，還沒有發現杜淹指使他人謀害牛把式和甄權的確鑿證據。
這個也不出預料，左少陽沒法子，這種情況下，如果自己堅持要求杜淹掛印躲回老家去，只怕不能贏得旁人的同情，反而會說自己太過分。因為既然杜淹指使謀殺的事情沒證據，他也按照自己要求辭職了，是皇上不同意，又拿出了三十多萬貫的鉅額家財設立免費醫治百姓的濟民醫館，這老小子在人情得分方面是佔了分的，只能慢慢來，爭取揪出他的狐狸尾巴。
左少陽又召開了一次基金會會議，選舉杜淹為基金會的名譽會長，規定不得干涉基金會的活動，只是掛個名，最多在名譽上代表基金會對外進行一些禮儀活動。這個虛職竟然讓杜淹感激不已，親自登門拜謝。當然，左少陽心裡嚴重懷疑這又是杜淹在作秀，爭取旁人的同情。
與此同時，彭炳的工作也有條不紊進行著，他雖然是吏部侍郎，不管戶部的事情，但是他親自交辦的事，戶部自然要遵從照辦。很快便把整個京城各個裡坊貧困人家的總數和具體人家摸清楚了。將列入醫療範圍的貧苦人家的名單全部張榜公佈，接受舉報質疑。
左少陽監督了全程