舉動，卻讓日本高層感到了很大的壓力。9月6日，林久治郎奉詔到東京，向田中首相彙報炸死張作霖的真相和東北局勢，商議對策。
在會上，8月中旬剛剛離任的滿鐵總裁山本條太郎提議，為在張學良手上完成先前與張作霖的密約，可以考慮以縮短商租權期限和放棄課稅權、警察權為條件進行交涉。但這個提案遭到政務次官森恪的反對，未獲透過。
最後，田中決定作出妥協：
為確立我在滿洲經濟活動的基礎，應先行開放該地使日人居住營業，並享有土地利用權。為此，日本也準備放棄治外法權。當前，則以大正4年（1915年）日中條約規定的在南滿居住往來自由及商租權，與張學良進行交涉。
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第一章 三場奇怪的戰爭·三個狼狽的軍閥（35）
7日，皇姑屯事件前後調駐南滿路沿線的日本駐朝軍第40旅團長仙波安藝，率本部自奉天省城撤回平壤原防。
10日，日本外務省與滿鐵在神戶舉行聯席會議，議定滿鐵應與張學良交涉簽訂吉會路（延長－吉敦）借款協約，並與吉長路聯合經營；由滿鐵承包鋪設吉敦等鐵路；允許滿鐵“開發”東三省經濟（整理奉票、設立東三省銀行等等）。具體由山本回任交涉。
11日，駐奉天的日軍第28炮兵聯隊、駐海城的第19聯隊也撤離回國。
9月24日，林久治郎返回奉天后，立即開始交涉。27日向張學良表示，如必易幟，須先解決滿蒙懸案。為“支援鐵路方面的交涉”，9月下旬，日本當局將關東軍從山東撤到遼東半島的旅順基地，並在長春留駐“有力部隊”。
但日方的鐵路要求和調兵舉動，激起了吉林學生示威運動。張學良和張作相以此為由