土著軍隊，除盧興邦、興榮及陳齊王宣尚保持電臺聯絡外，其餘各部電臺呼應不靈，郭援記得吳宇的提醒，此時也是按兵不動，靜待其變。
不久，經過蔣介石的瓦解，多半雜牌部隊都撤離了原駐地，那些不對的頭腦們得到老蔣升官發財的保證後，紛紛對十九路軍採取敵對措施。兩廣本來和十九路軍也有盟約，但看到福建政府聯合**放棄國民黨國旗之後也起來反對，特別是陳濟棠受蔣介石的收買獲得一百萬元的補助金，實行封鎖閩、粵邊各陸地交通，封閉十九路軍駐粵各機關。
關於陳銘樞和各省（包括湘、黔、滇、川、康、魯、陝）原來是有友好聯絡的，由於形勢不對頭，也沒有一省通電支援。原來方鼎英準備在湘西起義的也策動不起來。在國民黨中，除李烈鈞在上海來電聲援及陳博生來閩表示張學良在歐洲來電支援外，再無一人表示支援。
平時在國外的閩、粵籍華僑是熱烈支援十九路軍的，這次華僑支援的也寥寥無幾。而蔣介石一面利用其御用的國民黨中央政治委員會通電各軍政機關對“閩變”實行鎮壓，限令剋日平定，一面在“閩變”後第二天，以蔣中正個人名義發出告十九路軍將士書，痛訴陳銘樞賣國叛黨，煽動官兵反對福建人民政府。
緊接著，國民政府下令通緝李濟深、陳銘樞、陳友仁三人，撤消蔡廷鍇及蔣光鼐在國民黨的職務。從以上的情況，清楚看出福建事變是孤立無援的，原來政見相同的也由於取消國民黨國旗之舉反顏相譏；蔣介石決心調兵進攻的企圖已十分明確。造成福建政府匆匆應敵、處處被動的局面。
福建東臨海濱，海防遼闊，可以登陸的地方達二十餘處，特別是馬尾、廈門兩個軍事要港，在戰略上頗為重要。事變的當日蔡廷鍇即密令七十八師師長雲應霖（當時兼馬尾要塞司令）、廈門警備司令黃強，分別派部隊將馬尾、廈門兩個要塞司令部、馬尾海軍造船廠、廈門海軍航空處、長門炮臺、長門海軍練習營、彈藥庫等加以接收。但馬江要塞司令李孟斌所率的艦隊江貞、江元、楚觀三艦在二十夜脫逃，僅截獲海鵠、星星兩艦。至於駐閩的海軍陸戰隊一、二兩旅曾接受福建綏署指揮，“閩變”開始，這些部隊表示擁護人民政府，蔡廷鍇將該兩旅編為人民革命軍第一方面軍海軍陸戰隊，以原任旅長楊廷英、林秉周分任正副司令，企圖利用這些海軍艇隊及陸戰隊鞏固沿海口岸。
“閩變”開始時，一方面軍所轄各軍（即十九路軍所轄各師），散佈在閩東南西北，佈防千餘里地區。其地點大致如下：第一軍沈光漢部，全部集結在閩北沙縣及其以西地區。第二軍毛維壽部，一個師在閩北沙縣、延平間，軍部及另一個師在閩南之泉州、惠安地區。第三軍區壽年部，一個師在福州及馬江地區，軍部及另一個師在閩東南之莆田、涵江地區整訓（連城戰敗後）。第四軍張炎部，全部集結在閩西的龍巖、永定地區。第五軍譚啟秀部，在福州以西水口、延平間地區，一部在古田。總部直轄的特種部隊，有部分駐在漳州、廈門兩地。
福建乃是四戰之地，除與紅軍有約無西顧之憂外，其他諸方面都要設防，七萬多人的兵力，若散在四方，即無機動作戰能力，處處設防，則處處薄弱，特別是廣東背約投蔣之後，整個戰略上沒有後方根據地，當時閩西善後處所轄的各縣政府雖做一些計口授田工作，但作為一個後方也不牢固。
在“閩變”後的第三日，閩北沙縣被飛機轟炸，“閩變”後的第十日，閩南的泉州又遭轟炸。之後，蔣介石決心用南昌行營武力解決福建政府，福建政府的前途一片暗淡。
郭援這時候按耐不住行動了，將部隊調動到三都佈防，恰逢福建政府第一方面軍海軍陸戰隊在三都駐防，南京海軍部長陳紹寬正在爭取他們反水。郭援見狀，二話不說，先將陸戰隊繳械，而後收編，這樣一來得罪了陳紹寬，這位眼看功勞到手的海軍部長，一怒之下在老蔣跟前把郭援狠狠地告了一狀。
蔣介石在自己的弟子名冊中翻了半天，怎麼也查不到郭援這個人，心下明瞭郭援只不過是一支雜牌武裝。可這雜牌軍竟然敢搶著收編自己到手的武裝，這可令老蔣大為光火！此時南京政府已下令對福建政府進行“討伐”，計劃抽調二、三十萬兵力分批入閩，其第一批部隊約十萬人，分別由浙江南進，由贛東東進中。蔣介石見郭援部就在福建並且人數不少，乾脆又耍起了心機。 思量過後，老蔣給郭援發去一份委任狀，升其為中將兼福建平叛前敵司令，令其率部即刻對福建政府發動進攻！其用意是讓你們先打個兩敗俱傷，自己調集大軍在最後一齊拿下。