十三年正月，東魏河南大行臺侯景舉河南六州來附，被圍於潁川。六月，帝遣開府李弼援之，東魏將韓軌等遁去。景遂徙鎮豫州。於是遣開府王思政據潁川，弼引軍還。七月，侯景密圖附梁，帝知其謀，悉追還前後所配景將士。景懼，遂叛。冬，帝奉魏帝西狩咸陽。
十四年春，魏帝詔封帝長子覺為寧都郡公。初，帝以平元顥納孝莊帝功，封寧都縣子。至是，改以為郡，以封覺，用彰勤王之始也。五月，魏帝進帝位太師。帝奉魏太子巡撫西境，登隴，刻石紀事。遂至原州，歷北長城，大狩。東趣五原，至蒲州，聞魏帝不豫而還。及至，魏帝疾已愈，乃還華州。是歲，東魏將高嶽圍王思政於潁川。
十五年春，帝遣大將軍趙貴帥師援王思政。高嶽堰洧水以灌城，潁川以北皆為陂澤，救兵不得至。六月，潁川陷。初，侯景圍建鄴，梁司州刺史柳仲禮赴臺城。梁竟陵郡守孫皓以郡內附，帝使大都督苻貴鎮之。及建鄴陷，仲禮還司州，來寇。皓以郡叛，帝大怒。十一月，遣開府楊忠攻克隨州，進圍仲禮長史馬岫於安陸。
十六年正月，仲禮來援安陸，楊忠逆擊於漴頭，大破之，禽仲禮。馬岫以城降。三月，魏帝封帝第二子震為武邑公。七月，帝東伐，拜章武公導為大將軍，總督留守諸軍，屯涇北，鎮關中。九月丁巳，軍出長安。連雨，自秋及冬，諸軍馬驢多死。遂於弘農北造橋濟河，自蒲坂還。於是河南自洛陽，河北自平陽以東，遂入齊。
十七年三月，魏文帝崩，皇太子嗣位，帝以冢宰總百揆。十月，帝遣大將軍王雄出子午，伐上津、魏興，大將軍達奚武出散關，伐南鄭。
廢帝元年春，王雄平上津、魏興，以其地置東梁州。四月，達奚武圍南鄭。月餘，梁州刺史宜豐侯蕭修以州降武。八月，東梁州百姓圍州城，帝復遣王雄討之。
二年正月，魏帝詔帝為左丞相、大行臺、都督中外諸軍事。二月，東梁州平，遷其豪帥於雍州。三月，帝遣大將軍、魏安公尉遲迥帥師伐梁武陵王蕭紀於蜀。四月，帝勒銳騎三萬，西逾隴，度金城河，至姑臧。吐谷渾震懼，遣使獻其方物。七月，帝至自姑臧。八月，尉遲迥克成都，劍南平。十一月，尚書元烈謀亂，伏誅。
三年正月，始作九命之典，以敘內外官爵。以第一品為九命，第九品為一命；改流外品為九秩，亦以九為上。又改置州、郡、縣，凡改州四十六，置州一，改郡一百六，改縣三百三十。魏帝有怨言，於是帝與公卿議，廢帝；立齊王廓。是為恭帝。
恭帝元年四月，帝大饗群臣。魏史柳虯執簡書告於朝曰：“廢帝，文皇帝之嗣子，年七歲，文皇帝託於安定公曰：‘是子也，才由於公；不才亦由於公，公宜勉之。’公既受茲重寄，居元輔之任，又納女為皇后；遂不能訓誨有成，致令廢黜，負文皇帝付屬之意，此咎非安定公而誰？”帝乃令太常盧辯作誥喻公卿曰：“嗚呼！我群后暨眾士，維文皇帝以襁褓之嗣託於予，訓之誨之，庶厥有成。而予罔能弗變厥心，庸暨乎廢墜我文皇帝之志。嗚呼！茲咎予其焉避？予實知之，矧爾眾人之心哉。惟予之顏，豈惟今厚，將恐來世，以予為口實。”乙亥，魏帝詔封帝子邕為輔城公，憲為安城公。七月，西狩至原州。梁元帝遣使請據舊圖以定疆界；又連結於齊，言辭悖慢。帝曰：“古人有言，天之所棄，誰能興之，其蕭繹之謂乎。”十月壬戌，遣柱國於謹、中山公護與大將軍楊忠、韋孝寬等步騎五萬討之。十一月癸未，師濟漢，中山公護與楊忠率銳騎先屯其城下。丙申，於謹至江陵，列營圍守。辛亥，克其城，戕梁元帝，虜其百官士庶以歸，沒為奴婢者十餘萬，免者二百餘家。立蕭察為梁主，居江陵，為魏附庸。魏氏之初，統國三十六，大姓九十九，後多絕滅。至是，以諸將功高者為三十六國後；次者為九十九姓後；所統軍人，亦改從其姓。
二年，梁廣州刺史王琳寇邊。十月，帝遣大將軍豆盧寧帥師討之。
三年正月丁丑，初行《周禮》，建六官，魏帝進帝位太師、大冢宰。帝以漢、魏官繁，思革前弊。大統中，乃令蘇綽、盧辯依周制改創其事，尋亦置六卿官，然為撰次未成，眾務猶歸臺閣。至是始畢，乃命行之。四月，帝北巡。七月，度北河。魏帝封帝子直為秦郡公，招為正平公。九月，帝不豫，還至雲陽，命中山公護受遺輔嗣子。十月乙亥，帝薨於雲陽宮，還長安發喪，時年五十。十二月甲申，葬於成陵，諡文公。及孝閔帝受禪，追尊為文王，廟曰太祖。武成元年，追尊為文皇帝。
帝知人善任使，從諫如順流。崇尚儒術，明達政事，恩信被物。能駕馭