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這次審訊還有一點令人感興趣的是，它透露出波蘭地下政權裡各個政黨之間存在著不同意見，以及地下政權和倫敦流亡政府之間已經擴大了的分歧。揚科夫斯基指出，農民黨、社會黨和國民民主黨分裂成為各個派別，已經有一段時間了，其中有的支援華沙臨時政府，有的支援流亡政府。據巴京斯基說，農民黨的軍事組織“農民大隊”從來沒有同博爾…科莫羅夫斯基那樣的國家軍貴族領袖們真心誠意地合作過。米科拉伊奇克辭職後，農民黨就一直不贊成波蘭流亡政府，拒絕參加同“尼埃”有聯絡的政治組織。而且，波蘭流亡政府拒絕接受雅爾塔會議關於波蘭問題的宣言，看來引起了整個地下組織的反對。民族團結會議曾表示同意雅爾塔宣言，並把他們的決定通知了倫敦，倫敦顯然沒有理睬它。地下政權方面的大多數黨派於是決定公開活動，這就引起了談判的建議，從而導致了他們的被捕。
阿法納西耶夫在他的總結髮言中要求法庭判處徒刑，不要求處以死刑。法庭宣告所有被告除三名外全部有罪，並把四個主要領袖分別判處以下期限的徒刑：奧庫利茨基十年，揚科夫斯基八年，比恩和亞休科維奇各五年，其餘的人則分別被判處十八個月到四個月的徒刑。然而，阿法納西耶夫著重指出，這次審判是要“給蘇聯和進步人類的一切敵人，給所有那些妄圖舉起他們罪惡之手來干擾蘇波人民友誼的人一個嚴厲的警告”。
第七節 從1945年6月28日波蘭聯合政府的成立到1947年1月的選舉
（一）民族團結臨時政府
6月23日，莫斯科公審宣判後一天，莫斯科電臺宣佈華沙臨時政府、波蘭國內其他集團和國外的各方面波蘭領袖，已就臨時政府擴大後的人員組成問題達成了協議。除已在莫斯科的波蘭人大多數（包括米科拉伊奇克）將參加新政府外，還向波蘭國內和倫敦各政治集團的其他代表發出邀請。兩次大戰之間那段時期裡的一些右翼政黨，以及倫敦的那個在阿爾齊謝夫斯基領導下一心奉行反俄政策的波蘭社會黨右翼，則沒有被包括在內。整個農民黨、波蘭國內的著名社會黨領袖如祖拉夫斯基等，以及那批同克拉科夫大學有關係的自由…保守派人士都宣佈擁護新政府，這時同倫敦的分裂就顯得突出了。
盟國方面對這個宣佈表示大為滿意。舊金山會議正式表明，將在聯合國憲章文字上留出一個供波蘭新政府代表簽字的空白地位。美國和英國政府明確表示，只等波蘭新政府作出舉行自由選舉的保證，它們就承認新政府並撤銷對流亡政府的一切支援。流亡政府就莫斯科審訊以及新政府的性質提出的一些抗議都沒有得到人們的同情。
6月28日，參加莫斯科會談的幾個波蘭領導人飛抵華沙，不久華沙電臺就宣佈了新的民族團結臨時政府的組成名單。在政府的二十一個部長職位中，十六個由華沙臨時政府的前成員擔任，其他五個給予“被認可”的領導人：來自倫敦的三名，來自波蘭國內的兩名。那些從社會黨和農民黨分裂出來的一些派別，一開始就參加了波蘭民族解放委員會和華沙政府，現在則同各該政黨中與流亡政府和地下政權有聯絡的那些被認可的成員合在一起了，因此，至少從官職上看，這兩個黨在新政府中各有六個代表，波蘭工人黨（共產黨）也有六個代表。
給予米科拉伊奇克的歡迎表明，吸收幾個有影響的、參加過地下運動的戰前政黨領袖，也許會有助於取得群眾的擁護，而對波蘭民族解放委員會和華沙政府來說，這正是它一向極其缺少的。與此同時，流亡政府聲稱他們決不把權力交給這樣一個“不合法的”波蘭政府。從德國戰俘營獲釋後最近回到倫敦擔任司令的博爾…科莫羅夫斯基宣佈，在盟軍統帥部指揮下作戰於西歐的波蘭武裝部隊仍然忠於流亡政府。總部設在倫敦的政府和軍隊都宣稱，只有在波蘭真正獲得自由和獨立後他們才回去。
在雅爾塔，俄國領導人未能就波蘭西部邊界推進到西尼斯河一事取得盟國的同意；但俄國人在佔領了德國的東普魯士、波美拉尼亞、西里西亞各省之後，就讓華沙政府在這些地區設立行政機構。然而，雅爾塔宣言上規定波蘭的西部邊界將留待和會解決，因此美英兩國政府在4月間表示了他們的關切。俄國人就波蘭政府在但澤地區設立地方行政機關一事提出的理由是，德國居民已隨著德軍撤離該地，只留下了波蘭居民；但是這個解釋沒有被接受，美國政府在5月8日說，華沙政府似乎打算在俄國支援下在這些地區內建立永久性的行政機構。照會指出，未經盟國間磋商就作出這樣的改變，忽視了商定的管制