時，瑞士將保持中立。德國公使於五天前拜會莫塔，重申德國保證尊重瑞士的中立。8月31日，義大利公使作了一個類似的保證，答應瑞士可以任意利用義大利的港口進口必需品。9月2日，政府下令瑞士軍隊進行總動員。在波蘭遭到入侵後，接踵而來的是一系列的命令，包括暫時禁止出口，16…65歲的男子和16…60歲的女子有義務參加強制勞動，並由經濟部長奧佈雷赫特負責籌建戰時經濟機構。規定由政府控制瑞士的進出口貿易，對任何逃避管制命令的人採取嚴厲的懲罰措施。還成立了一個由政府代表和工業代表組成的諮詢委員會在蘇爾澤委員長（一個傑出的實業家）領導下監督進出口業務。
為了維護國家安全、鎮壓間諜活動和管制報紙及其他新聞機構所頒佈的法令使軍事當局在這些領域中享有廣泛的權力以履行他們的職責。
“假戰爭”期間，給了政府和軍事指揮部一個喘息的機會用來鞏固和加強瑞士的防務。修訂了軍事計劃，加強了防禦工事，對軍隊進行了緊張訓練。由於在瑞士邊境附近並未發生什麼軍事行動，因此9月份動員起來的許多部隊得以返回各自的日常工作崗位，但還保留了約二十萬名的武裝部隊。1940年為現役軍人制訂了補償方案。為補償現役軍人在工資和其他收入方面的損失所需的資金是從向所有僱傭勞動者和僱主強派捐款並向聯邦和州政府籌集得來的。
1939年11月1日第一批發行的定量配給卡只對一部分食品有所限制，且對定量日用品的分配是很充裕的。由於義大利的中立和友誼，瑞士人得以進口了大量的貨物來充實他們的物資儲備。儘管在戰爭開始的幾個月中進出口貿易都大幅度下降，但隨後幾個月卻飛速回升，特別是進口，不單在價值上而且在實際重量上也都超過了往常年份。在這段時間裡，和德國的貿易尚少糾葛，因為德國認定採取放寬出口的方針對它有利。瑞士經濟上的主要麻煩來自英國，原因是英國的戰時經濟迫使其拒不履行戰前簽訂的有關奢侈品和半奢侈品的訂貨合約，也由於封鎖關係給中立貿易帶來了許多大有影響的限制。經過幾個月的三邊會談，終於在1940年4月25日同英國和法國達成了一項全面的戰時貿易協定，這在一定程度上緩和了封鎖對進出口的影響。不過，只有某些種類的貨物可以在指定的情況下再出口到敵國或中立國，而其他貨物包括貴重原料則必須持有一張保證不將這類貨物再出口的執照，才能獲准透過盟國的禁運品管制關卡。
許多瑞士人相信或希望在西線長時間的寂靜意味著雙方都不準備最後一決雌雄，德國將不至於冒險直接進攻法國。有些人甚至引用德國入侵遠處歐洲邊緣的斯堪的納維亞國家這一事作為這種理論的依據。其他比較不那麼一相情願的人則正確地看到，德國對斯堪的納維亞國家的侵略正是一場暴風雨來臨的前奏。無論如何，有兩點是再清楚不過的：沒有一支常備不懈的防衛部隊作後盾，“正確”的中立作為一種保障是無效的；在一個漫不經心或悠然自得的國家裡第五縱隊的活動是危險的。2月中旬，瑞士聯邦議會國民院的議長瓦洛東曾從魏茨澤克得到他的私下保證，德國殷切希望不讓瑞士捲入戰爭，然而這當然不能把它視作一種承諾而寄以任何信賴。
4月28日，由1940年的聯邦主席馬塞爾·皮萊…戈拉和吉桑將軍簽署了一項公告，指示休假計程車兵和公民在一旦敵人進犯時應該做的事情，並告誡人民不要盲從失敗主義者的宣傳。與此同時，還增強了邊防部隊。
瑞士人害怕德國在向馬其諾防線以北的中立國家發動進攻時，可能企圖強行透過瑞士的南端。因此，當德國在5月3日侵入低地國家後，瑞士緊接著在5月10日就對武裝部隊進行總動員。少年和年老體弱、不適服現役的男子都組織起來成為地方防衛力量以協助打擊空降兵和第五縱隊。所有重要的戰略點和交通要道都佈置了警戒。
在提防第五縱隊的一些額外防衛措施中包括了對外國僑民實行更嚴格的控制。5月11日，下令所有擁有火器的外國人都要立刻把武器上繳警察局。5月20日，司法部和警察又奉命立即驅逐所有“不受歡迎”的外國人出境。5月28日的一項聯邦法令將刑事軍事法典中的規定擴大適用於在服役期中的平民。這表明，迄今為止僅適用於戰時的死刑將同樣用於犯有進行叛國、間諜、破壞活動罪行的人和散佈假訊息的造謠者。
5月14…15日夜晚，當入侵被認為迫在眉睫時，瑞士人的恐慌心理達到了頂點。大批德國部隊在瑞士北部邊境的黑森林中集結。雖然瑞士軍隊在吉桑將軍的鼓舞