國敕令的名義重新發布的。在這以後，就以內閣命令的形式釋出了。中央聯絡局還負責安排盟軍最高統帥部的官員同日本方面適當的官員之間的會談。
雖然這樣的組織形式和各組織的職責與權力上的分工將佔領中的軍事與非軍事這兩個方面很清楚地分開了，但還是有很明顯的不足之處。在東京制定政策的總司令部各參謀局與在外面直接搞工作的軍管工作人員之間只有一種薄弱的、間接的關係。例如，一項關於教育方323 劊的政策指令，是由宣傳和教育局制訂的。然後，透過中央聯絡局發給日本文部省。這項政策指令又透過各軍、師的參謀長轉發給軍管人員中主管教育的官員。有時，日本地方上負責教育的官員也可能先於軍管的官員從文部省接到指令。而且，由於軍管的有關官員不直接對專職參謀局負責，而只向自己的師長負責，所以他不明白髮出這些指令的理由。這種關係也給軍管官員向總司令部彙報總司令部最感關切的情況造成了困難。儘管有這些困難，這一基本的組織形式在麥克阿瑟控制的整個期間一直沒有改變過。
第三節 走向民主化的早期措施
（一）建立民權
在過去十多年的時間裡，日本的軍界首腦控制了全體日本人的思想和行動。在當代，他們的政治覺悟處於最低潮，那些使日本成為一個獨裁國家的法律和敕令依然在行使。那些還活著的反軍國主義的人士還關在監獄裡。幾乎沒有什麼日本人懂得民主對他們自己或對他們的國家意味著什麼。因此，麥克阿瑟認識到，他首先要完成的非軍事任務之一，是創造一種氣氛，使民主的態度和民主的實行能發揚起來。
因此，在佔領的歷史中，有六個只的時間主要是用來發展新的政治自由。民權建立起來了。召開了國會，以制定一個較自由的選舉法。新憲法草案經盟軍最高統帥部批准並公佈出來，供大家考慮。開展了整肅，將那些可能反對民主改革的人撤離重要職位。舉行了戰後第一次大選。
雖然這幾件事是同時進行的，但保證言論自由是盟軍最高統帥部首先採取的行動之一。早在1945年9 月27日，盟軍最高統帥部就命令日本取消一切對通訊自由的限制，廢除那些給予政府控制報刊、電臺權力的法律。因而現在如果哪一個日本人想批評日本政府、政府的政策、甚至天皇制度，他都可以批評，不用擔心會受到報復。1945年10月4 日，盟軍最高統帥部發布的那個通常被325 稱為“日本人權法案”
的指令，進一步喚醒了人們的政治覺悟，促進了一些新政黨的建立。正如盟軍最高統帥部解釋的那樣，發表這個指令是“為了消除對於政治、民權和宗教自由的限制，消除基於種族、民族、信仰或政見的歧視”，該指令命令廢除所有限制這些基本人權的法律。所有由於違犯了這些法律而關進監獄的犯人應千10月10日前全部釋放。
剝奪了負責全部民事警察活動的年務省的一切獨裁權力。內務大臣和他的一批高階警官被撤職，負責思想統制和行動統制的“特別高等警察”被撤銷。禁止一切警官干涉個人自由。
這一指令的發表立即引起了政治反響。首先是東久邇首相聲稱，如果沒有“思想統制”，他就無法管理。因此，東久選內閣於1945年10月5 日總辭職。在這以後的幾天內，作了一些努力來挑選一個能擔任首相的人。這個人必須是沒有積極支援過日本的侵略行動，能與盟軍最高統帥部合作，並願意只在舉行大選之前的這幾個月內任職的。最後，選中了幣原喜重郎男爵。幣原是個七十三歲的前外交官，他以往在政界活躍的時期是在1931年。他是新的“改進黨”的領袖，但是他在挑選內閣大臣時，不是根據黨派關係，而是根據他們本人的條件。他的大臣大部分都是與外國人打過交道的有經驗的保守派。市原擔任首相，直到1946年5 月22日為止。許多最重要的政治改革都是在他擔任首相期間進行的。
發表“日本人權法案”的另一個結果是政治活動又突然活躍起來了，特別是各“左派”政黨。在日本歷史上，共產主義者第一次得到了建立政黨的合法權利。象志賀義雄和德田球一那樣的共產黨領導人都從監獄裡放出來了。志賀是黨的主要理論家，德田後來擔任總書記。他們出獄後立即投入了組織政黨的工作。這個政黨很快就成為一支重要的政治力量。長久以來彼公認的共產黨領袖野坂參三，也從他流亡的華北迴國。1945年10月20日，共產黨的官方報紙《赤旗報》創刊了。《赤旗報》主張自由分掉荒廢的土地，沒收工業，取消天皇制，貴族辭職，並同社