前意屬殖民地和英國同衣索比亞皇帝關係的重要的政策性問題方面，須請示國務大臣予以指導。其目的在於使被佔領敵區行政機關成為國務大臣辦公室的一個聯絡部門，象中東補給中心和其他機構一樣。可是，政治指揮部設在內羅畢，實際上對國務大臣來說，鞭長莫及，難於行使有效的管制。何況，關於同衣索比亞皇帝簽訂協定的談判主要是在倫敦舉行的。因此，當英國在1942年1月簽署協定後隨即委派外交代表去亞的斯亞貝巴時，衣索比亞恢復了同其他中東獨立國家一樣的地位，英國公使也成為中東戰時委員會的成員之一。後來，隨著戰爭形勢的發展和最終佔領了整個昔蘭尼加和的黎波里塔尼亞，被佔領敵區行政機關的總部遷往開羅，更加直接地在國務大臣的領導下執行任務。在這方面，舉行了關於昔蘭尼加薩努西亞的領袖賽義德·伊德里斯要求政治承認問題的會談。由於國務大臣提出的建議，英國外交大臣於1942年1月在議會宣佈：英國政府決定昔蘭尼加的薩努西亞戰後不論在什麼情況下，不再歸屬義大利統治。
在委派國務大臣以前，關於中東地區的宣傳，沒有任何集中管理的安排。情報部的代表從屬於各個外交使團，還有其他的一些獨立機構，處理政治戰略方面的宣傳事宜，利特爾頓到任後不久，就發出指示，對整個地區的宣傳管理進行調查。根據調查結果，他提議任命一位宣傳局長，配備少量工作人員，作為國務大臣辦公室的一個聯合部門，掌管情報部在中東的一切活動。另外，沃爾特·蒙克頓爵士被任命為副國務大臣，由他主持協調情報部所負責的各種宣傳方式以及這個地區的一切秘密的或顛覆性的宣傳工作，可是他在議會中並無席位。關於宣傳工作的總方針，從倫敦情報部和政治戰執行委員會發來的指示中都有規定。根據這些具有政策性的宣傳總方針，制訂對中東國家和巴爾幹半島各國敵佔區的宣傳工作的具體指示，有公開的，也有秘密的。同時，各個英國外交使團得按照它們自己的方式執行倫敦和開羅的指示。在這些問題上，英國駐外各代表或他們的東方秘書都有較大的迴旋餘地，根據有關地區的具體需要調整他們的宣傳工作。
為了處理好各個負責搞顛覆活動機構之間的關係，國務大臣也作出了特別安排。這些機構過去一直各自接受它們在倫敦的總部直接發來的命令，並且時或表現出互不相容。後來成立了一個從屬於防務委員會的小組委員會（通稱中東和巴爾幹地區特種作戰執行委員會），由國務大臣擔任主席，使顛覆活動同各總司令所執行的戰略方針和計劃緊密地協調起來，同未來外交工作上的需要緊密地協調起來，以確保一切顛覆活動和宣傳工作符合政府的政策。這些機構的性質使它們不能忍受任何形式的集中管理，卻證明是給國務大臣和外交部造成困難的根源。隨著戰事的進展，這些機構的重要性增加了。資金是從來不缺乏的，然而現在需要提供越來越多的物資，特別是飛機。當需要利用諸如希臘極端左翼組織（通稱全國人民解放軍）之類願意為反對軸心國而效勞的任何力量時，這些活動中的一些工作就開始了；事實證明要執行國內政府的政策是有困難的，有時甚至辦不到。儘管如此，國務大臣辦公室的存在減少了重複繁瑣，並且大大加強了對顛覆活動的控制。
中東地區的其他情報機構，諸如中東情報中心一類的組織，同樣被納入這個地區的總的情報體制。因為這些機構中大多數不僅在中東各有它們的上級，而且還隸屬於白廳各個部門的領導，因此要協調它們的各種活動顯非易事，這是可以想見的。可是，隨著對國務大臣辦公室的信任不斷增長，它越來越被當作一箇中央上訴院，各個部門都可把它們的問題帶去，深知辦公室將會作出公平合理、不存偏見的判斷，並且在必要時作出最後的決定。如果任何組織不同意國務大臣辦公室的裁決，則可向白廳請示，以便在倫敦各部門之間或在國務大臣和倫敦的有關大臣之間直接達成協議。
在中東，檢查工作存在著特殊困難。在有關獨立國家中，其安排大都是根據戰爭期間簽訂的聯盟條約或達成的特別協議而作出的；地方當局按照條約或協議的精神實施檢查制度，大都由地方官員予以執行。在許多情況下，這些機構中都派駐英國檢查員，但在他們下面負責具體工作的都是當地人，這些人員儘管一般說來尚屬可靠，卻仍需英國官員的經常監督。於是決定在國務大臣辦公室設定一名檢查顧問，在沃爾特·蒙克頓爵士領導下，負責監督整個中東地區的郵件、電報和報刊的檢查工作。在任命國務大臣以前，報刊檢查的安排顯得特別困難。在同盟國部隊中有大批