胡惟庸在覺得一切準備完畢之後，就於明太祖洪武十三年（公元1380年）正月，奏告朱元璋說京宅井中出了一眼甜泉，乃是大吉大利之兆，請朱元璋前去觀看。朱元璋竟信了他的話，駕車從西華門出發，準備前往。就在這時，內使雲奇突然闖入蹕道，勒住了朱元璋的馬韁繩，極力勸阻朱元璋，說是不可前往。由於情勢太急，雲奇聲調急促，以至不能說明白。朱元璋見此情景大怒，以為雲奇放誕不敬，就喝令左右用金錘撾擊。雲奇斷了胳膊，撲倒在地，氣息奄奄，但卻用手指著胡惟庸的宅第方向。這時，朱元璋忽然有悟，忙登上高處向胡惟庸的宅第方向看去，但見胡宅中隱隱透出兵氣，朱元璋大驚，立即發兵前往捉拿。
不一會兒，羽林軍就將胡惟庸及埋伏的甲士捉拿歸案，經過對質，胡惟庸無法抵賴，只得承認。胡惟庸被牽至市曹，凌遲處死。
朱元璋當然不肯罷休，他派出官吏，四處拷掠，把胡惟庸一案的新賬舊賬一同清算，由擅權枉法到私通日本、蒙古，再到串通李善長等人謀反，由此牽連到的胡惟庸的親族、同鄉、故舊、僚屬以及其他關係的人皆被連坐誅族，先後殺掉了三萬多人。
又過了十二年，藍黨之獄又成。涼國公藍玉，是著名的武將，也是開國功臣，但為人桀驁不馴。藍玉與太子朱標是間接的親戚，往來很親密。藍玉在北征時看到燕王朱棣的行止，深感不安，回來後對太子說：“我看燕王在他的封地裡實在是太威風了，其行止不亞於皇帝。我還聽說燕地有天子氣，願殿下細心防備，免生不測。”太子為人生性忠厚，不願生事，就對藍玉說：“燕王對我十分恭順，決不會有這樣的事。”藍玉見太子不信，只好自找臺階說：“我蒙受殿下的恩惠，所以才秘密地告訴你涉及利害的大事。但願未被我言中。”
不久，太子病死，朱元璋覺得燕王朱棣為人陰鷙沉穩，很像自己，就想立他為太子，但一些大臣反對，覺得於古禮不合，也對其他皇子無法交代，朱元璋只好立了朱標的兒子做皇太孫。燕王朱棣見太子已死，無人替藍玉說話，在入朝奏事的時候就對朱元璋說：“在朝諸公，有人縱恣不法，如不處置，將來恐成尾大不掉之勢。”朱棣雖未明指藍玉，但大家心裡都清楚，藍玉曾在太子面前說過朱棣，朱棣現在要施行報復了，再加上“縱恣不法”四字，更是確指藍玉。
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武力開國與暴力固權（5）
在這種情況下，藍玉竟還率性而為，一點也不檢約自己。他出徵西番，擒得逃寇，且捉住了建昌衛的叛帥，自以為功勞更大了，愈發得意洋洋，本以為回朝後定會大有封賞，沒想到朱元璋根本就不理他。到冊立皇太孫時，他滿以為會讓自己做太子太師，卻沒想到自己還是太子太傅，反倒讓馮勝、傅有德兩人做了太子太師。藍玉十分憤怒，扯著袖子大喊道：“難道我還做不得太子太師嗎？”他這一番鬧騰弄得朱元璋更不高興。
自此以後，藍玉上朝奏事，沒有一件能夠獲准，但藍玉不僅不知收斂，還更肆無忌憚，即使陪皇上吃飯，也出言不遜。一次，他見朱元璋乘輿遠遠經過，便指著說：“那個乘輿的人已經懷疑我了！”此語一出，大禍即來。其實，藍玉並未像胡惟庸那樣謀逆，只是“禍從口出”罷了。錦衣衛聽到了這句話，立刻報告藍玉謀反，並說他與鶴慶侯張翼、普定侯陳垣、景川侯曹震、舳艫侯朱壽、東莞伯河榮、吏部尚書詹徽、戶部侍郎傅友文等人設計起事，欲劫皇上車駕。朱元璋聽了，正想殺人而找不到藉口，便不問青紅皂白，一齊拿到朝廷，並親自審問，再由刑部鍛鍊成獄，以假作真，全部處死。
僅此還嫌不足，凡與藍玉偶通訊問之人，也不使漏網，四面構陷，八方株連，朝廷中的勳舊，幾乎一掃而空。此次前後共殺一萬五千餘人，與胡惟庸案並算，殺者共計近五萬。
至此還不罷休，藍黨之獄過後年餘，穎國公傅有德，奏請土地，不僅不準，反予賜死。宋國公馮勝，在缸上設板，用碌碡打稻穀，以作打穀場，聲響遠震數里，有仇人狀告馮勝私藏兵器，朱元璋把他召入廷內，賜以酒食，說是決不相信別人的謠言。馮勝喜不自盡，誰知剛剛回到家裡，即毒發而死。定遠侯王弼，在家裡曾嘆息說：“皇上春秋日高，喜怒無常，我輩恐怕很難活下去了！”這一句話，果然被特務告密，立即賜死。
這樣一來，開國功臣已所剩無幾，即便有幾個，也早已遠離朝廷，不涉政事了。徐達、常遇春、李文忠、湯和、鄧愈、沐英六人得保首領，死皆封王，但徐、常、李、鄧四人都死在胡藍大獄之前，沐英鎮守雲南