心動搖，數日後河南新軍暫編第二十九混成協發生譁變，殺協統劉承恩，聯合毅軍趙倜所部圍攻第二軍司令部，欽差大臣升允見勢不妙，單人匹馬逃往潼關，清軍第二軍失去統一指揮，就此解體，變兵將信陽軍儲洗劫一空之後，一部分舊軍北上投奔了北洋軍，新軍則大多向南開拔，與共和軍北伐先遣游擊隊取得聯絡，隨即宣佈加入革命軍，響應起義。
閩浙總督松壽於福州拍發“討逆通電”，歷數袁世凱“弒君”、“謀逆”等種種大逆不道之罪行，誓言用袁世凱人頭祭奠大行皇帝，隨即募集壯丁，號“勤王軍”，舉兵於福建，同時聯絡各國領事，尋求列強支援，但均遭拒絕。
數日後，福建新軍暫編陸軍第十鎮一部於福州城北蓮花山駐地起義，在同盟會員、福建武備學堂總教習許崇智的率領下聚攻北門，與此同時，以閩籍會員為骨幹的同盟會敢死隊在福州城內發動進攻，圍攻設於花巷的第十鎮司令處，激戰不久，福寧鎮總兵、第十鎮統制官孫道仁在鎮司令處宣佈反正，隨後在敢死隊員的“保護”下走出司令處，調集城內新軍聚攻總督衙門，閩浙總督松壽走投無路，焚燬總督衙門，舉家投火，在熊熊烈火中，福建宣佈脫離清廷統治，同盟會推舉孫道仁為福建都督，許崇智為閩軍總司令，隨即閩軍分兵兩路，一路北伐浙江，另一路則向閩南漳州挺進，與早已攻佔漳州的廣東起義新軍殘部會師，以便合兵南征廣東。
正在川北督促各團防局抽丁編練“討賊軍”的四川總督、漢軍正藍旗旗人趙爾巽聞知北洋軍變，匆匆返回成都坐鎮，將四川新軍暫編第三十三混成協解除武裝，全部調往城外，另換巡防營入城拱衛，佈置妥當之後，即