中國外務部召開特別會議，宣佈支援蘇門達臘獨立主張，中國海軍將協助當地民團繼續作戰，直到荷蘭接受蘇門達臘獨立現實，同時，外務總長唐紹儀也對記者表示，此次南洋戰爭中，中國、日本各自單獨作戰，並非聯合作戰，因此，從法律上講，中國與日本並未正式結成軍事同盟，中國將在歐洲戰爭中繼續保持中立立場。
4月28日，巴達維亞陷落的訊息得到證實，荷蘭國內一片恐慌，金融發生劇烈動盪，由於關於荷蘭政府即將參加對德戰爭的謠言四起，荷蘭國內食品與燃料價格猛漲，並最終引發國民抗議，荷蘭首相不得不發表公開講話，宣佈荷蘭將繼續在協約國與同盟國的戰爭中保持中立，以此穩定人心，作為對荷蘭政府表態的反應，英國政府和法國政府在荷蘭首相發表公開講話當天即宣佈停止對南洋戰爭的調停努力，並在中荷、日荷戰爭中保持中立。
4月29日，走投無路的荷蘭政府向美國政府尋求幫助，經過兩日磋商，美國政府在猶豫之後，終於在5月1日宣佈接受荷蘭政府的託管請求，從當天起，美國菲律賓殖民當局將從荷蘭東印度殖民當局手中接管婆羅洲的一切事務，並宣佈，從5月1日起，直至戰爭結束，婆羅洲地區為“局外中立地區”，任何交戰國的武裝力量和準軍事組織都不得在這一地區實施敵對軍事行動，否則，美國軍方將採取必要措施維護婆羅洲地區的和平與穩定。
5月1日下午，美國政府透過外交機構分別向中國、日本政府遞交了相關外交檔案，就婆羅洲地區在南洋戰爭中的地位問題與兩國政府進行了交涉，當天晚上，中國中樞政府宣佈接受美國方面建議，不對婆羅洲地區實施軍事行動，次日下午，日本政府也宣佈接受美方立場，不對婆羅洲用兵。
5月2日，中國海軍南洋分艦隊炮擊了爪哇島東部重鎮泗水，並掩護蘇門達臘民團實施登陸作戰，於當天控制泗水，至此，荷蘭在爪哇島的殖民統治土崩瓦解。同日，中國陸軍區域性動員，首批陸軍部隊由廣州登船，前往海南島。
同一日，日本海軍艦隊進攻馬魯古群島，並出動飛機轟炸了島上荷軍兵營。
面對中日兩國軍隊的夾攻，荷蘭東印度殖民當局已完全無法控制當地局勢，婆羅洲、馬魯古、錫裡伯斯、安汶等地區陸續爆發土著民暴動，荷蘭對東印度群島的殖民統治已呈土崩瓦解之勢，東印度群島的動盪局面進一步波及到了整個東南亞地區，馬來亞、菲律賓、法屬印支殖民地、英屬緬甸殖民地均發生了反殖民暴動，雖然很快被殖民軍鎮壓下去，但是“亞洲獨立”的呼喊正隨著南洋戰火的熊熊燃燒而高漲，受此形勢影響，在歐洲西線與德國軍隊作戰的印度軍隊中出現“印度獨立”的呼聲，並影響到了軍隊士氣，隨後不久，由於法國軍隊中厭戰情緒蔓延並進而導致兵變，協約國西線攻勢大減，德國軍隊趁機反攻，西線戰局一度岌岌可危，英國遠征軍甚至已制訂了協助法國軍隊保衛巴黎的巷戰作戰方案。
南洋戰爭牽動歐洲西線戰局，歐洲西線戰局牽動英國、法國政局，在岌岌可危的形勢下，英國、法國只得繼續向荷蘭政府施加外交壓力，迫使荷蘭政府儘快接受現實，接受中國、日本政府提出的和平條件，以期儘快結束東南亞的動盪局勢。
5月6日，荷蘭王國政府宣佈接受英國、法國、美國、俄國調停建議，單方面宣佈在東印度群島戰區實現停火。同一日，暹羅（泰國）政府向荷蘭政府遞交外交備忘錄，要求荷蘭東印度殖民當局加強對當地暹羅僑民的保護力度，不然，暹羅政府將“採取必要措施保護本國僑民”，與此同時，暹羅海軍的兩艘驅逐艦出現在婆羅洲近海，不過很快就被美國軍艦驅逐。
5月7日，中國宣佈接受荷蘭停火倡議，在蘇門達臘、爪哇戰區實現停火，次日，日本也宣佈接受荷蘭停火倡議，在已佔領地區實現停火。
5月9日，中國、日本、荷蘭三國代表在瑞士日內瓦舉行正式會晤，討論結束南洋戰爭事宜。
同一日，暹羅（泰國）發生政變，政府倒臺，親德派政府官員被關押進兵營，英國、法國殖民軍隊隨即宣佈“應邀”進駐暹羅首都，幫助維持局面，當天，暹羅政府即宣佈加入協約國集團，參加對德戰爭，次日，中國、日本政府分別發表政府公報，宣佈不承認暹羅新政府之合法性，要求政變者立即釋放被囚禁的政府官員，與此同時，兩國也宣佈，暫時停止日內瓦會談，恢復在南洋戰區的“自由行動”，受此要挾，英國、法國政府只能“建議”暹羅新政府釋放被關押的舊政府官員，隨後，在英國軍隊的保護下，這些人前往中國、日本使館