一年之後，丘處機帶著眾弟子西行，終於在阿富汗，見到六十多歲的成吉思汗。雙方相談甚歡。
這時候的成吉思汗最渴望的就是得到長生之藥。他這個想法和嗑“仙丹”而亡的秦始皇、唐太宗，倒是不謀而合。
但丘處機的回答，讓成吉思汗大為失望。
丘處機告訴成吉思汗，“這世界上只有衛生之道，沒有長生之藥。大汗想要延年益壽，唯有止殺愛民”。
聽丘處機這話，可以看出一代真人的真誠和坦率。他並沒有獻上所謂的“仙丹”，來討好成吉思汗，而是勸他向善。
雖然丘處機沒有成吉思汗真正想要的“秘方”。但成吉思汗經過一年的相處，對丘處機十分敬佩。
後來，成吉思汗賜予丘處機虎符璽書，並把原金帝國的御花園，賞給全真教傳道。
還讓丘處機“掌管天下的出家人”，並敕免全真門下道士的差役賦稅。在成吉思汗的支援下，全真教進入全盛時期。
鐵木真時期，黃金家族信的是全真教。
到了窩闊臺時期，事情發生了微妙的變化。這一切要從多達那波入吐藩開始說起。
當時，窩闊臺的次子闊端，是蒙古帝國西路軍的首領。南宋嘉熙元年，闊端令大將多達那波，領軍入吐藩。
這時候的吐藩四分五裂，並不是一個統一整體，根本無力抵抗蒙古大軍。吐蕃的分裂是王權與教權之爭的結果。
佛教在吐蕃的發展，已經讓僧人成為社會的特權階層。
吐蕃的官僚無權捉拿涉案僧人，無權過問寺院的收入。
甚至有“用手指點僧人，斷其指；用眼睛瞪僧人，剜其目”的惡俗。
會昌二年，吐藩贊普——朗達瑪為了遏制教權的膨脹，決心推行滅佛政策。這和鐵木真殺闊闊出的道理是一樣的。
但朗達瑪最終是失敗了，自己被狂熱的佛信徒所殺。吐藩王室為了爭奪王位陷入了內戰。
而佛教勢力也不想王權再次崛起，更是推波助瀾。吐藩從此陷入四分五裂，再也無法成為一個統一整體。
起初，多達那波進軍吐蕃很順利。但很快，他就遇上了麻煩。
一些佛教高僧不服蒙古人的統治，鼓動僧人和信徒，主動對多達那波的軍隊進行瘋狂進攻。
但未經軍事訓練的僧人和信徒們，顯然還不是久經沙場的蒙古軍隊對手。
多達那波對僧人和信徒進行了無情鎮壓，僅僅在一天內，就屠殺了近千人，並燒燬了幾座寺廟。
但這些狂熱者的表現，震驚了多達那波。
他們的裝備雖不如蒙古軍士，但在戰場上無所畏懼的表現，比蒙古勇士更像個勇士。
而且，佛教徒們的反抗還在繼續。
不得已，多達那波開始妥協，修復了被毀的寺院和佛殿，並請高僧廣做法事，以平息佛教徒的怒火。
之後，多達那波在吐蕃生活了兩年多，頻繁與藏傳佛教的高僧們進行友好交往。
在這期間，他認識到，藏傳佛教在吐蕃地區的影響力，是無可比擬的。
蒙古帝國想要在吐藩地區實現長治久安的目標，光靠武力是不行的，必須要獲得佛教勢力的支援，就像當初通天巫闊闊出對鐵木真的神力加持一樣。
多達那波選擇薩迦派的宗教領袖——班智達，作為與帝國合作的物件。
吐蕃地區的佛教派系很多，但薩迦派是信徒最多的一派。
多達那波把自己的想法，向西路軍主帥闊端報告。其中心思想就是“因其俗而柔其人”，意思就是和佛教勢力共治吐藩。
闊端採納了他的意見，並邀請班智達來涼州細談。班智達帶著信徒們赴約了。
這次涼州會談，闊端代表皇族，對班智達既有武力上的恫嚇，也有利益上的誘惑。
班智達為了避免吐蕃再陷入戰火，也為了藏傳佛教的發展，選擇和黃金家族合作。
回去以後，班智達開始讓本派信徒和勸說佛教其他派系，順應潮流，誠心歸附蒙古帝國。
薩迦派的努力，讓蒙古帝國在吐蕃地區的統治得到了鞏固。
也就是說，蒙古人對高麗，用的是女人聯姻；對吐藩，用的是佛法馴化；都挺好用的。
從此，利用佛教治理吐藩，成了大元一朝的慣例。後來，元廷還設立宣政院，專門負責管理吐藩和佛教。
作為回報，藏傳佛教在元廷的支援下，大規模走出吐蕃，向全國廣泛傳播。