隆慶皇帝的關係，被隆慶皇帝封為一個七品知縣。只有秦泰這個看似裕王最信任的屬下，不但沒有得到任何封賞，而且被半囚禁似得關在自己的老家，只保留了讀書人的身份，就連候補官員也算不上。後來為了要使用秦泰，不得不給了一個半公開的身份，但是並沒有恢復秦泰正式官員的想法。事後秦泰沒有等到恢復官方身份的機會，卻被看押在京城。當時雖然多方勢力都不願意秦泰出頭，但是當時隆慶皇帝堅持的話，秦泰不會這樣的。隆慶皇帝不但沒有支援秦泰，反而站在了反對秦泰出來的最前面。從那時候起秦泰和隆慶皇帝之間的友情已經徹底沒有了，隆慶皇帝也從來沒有承認過秦泰這個朋友。
張居正和譚綸不止一次地承諾過，一定會幫秦泰儘快恢復身份，讓秦泰重新可以名正言順的獨立辦案。可是到最後都不了了之了，其中有多種因素存在，但是最主要的原因是隆慶皇帝不同意。就算是後來太子親自昂秦泰說話，希望父皇隆慶皇帝讓秦泰出來當官，隆慶皇帝依然是不同意。大有他