機扼殺在萌芽狀態。馬皇后死後，朱元璋才知道這個組織，並覺得這個組織很好，就這麼保留了下來。
第二種說法是烈士後代說。據說朱元璋投身紅巾軍之後，利用他的個人魅力，召集了一大批的生死兄弟。當時大多數的兄弟都沒有成家，抱著險中求富貴的心態參軍。他們的想法很簡單，要麼成功了將來發大財享富貴，要麼失敗了人頭落地，大不了十八年後再來過好了。朱元璋為了控制和討好大家，聯合新婚不久的妻子馬秀英，為大家張羅婚事。凡是戰事間隙，或者是有空的時候，都會有一兩個老部下成親。這些人有了老婆，就不會在離開朱元璋。朱元璋帶著兄弟在前線殺敵，馬秀英帶著各位夫人們在後方為丈夫們搞後勤。隨著一個個老部下戰死，這些老部下的孩子們成為了沒爹的孩子。一些孩子的娘為了生活離開了，一些孩子的娘在馬秀英的介紹下又嫁給了丈夫的戰友。孩子們漸漸聚集在一起，平時由馬秀英照顧。朱元璋在有空的時候也教孩子們一些軍事知識，在他看來這些孩子才是最可以信任的子弟兵。漸漸地孩子們長大了，一些人投身了戰場，成為了一個個小將軍。但是更多的孩子失蹤了，外人並不知道他們去了哪裡。其實朱元璋把他們安排在秘密戰線上，有的成為了商人，在敵佔區做情報收集工作。有的留在軍隊裡，用各種身份作掩護，監視著一些朱元璋不相信的將領。有的索性成為老百姓，混在老百姓裡打探老百姓對大明軍隊的看法。一點那有人煽動大家，或者說不利於朱元璋的話，他們就會神不知鬼不覺地動手。後來朱元璋建國之後，繼續沿用這些人。並把他們的後代也訓練起來，成為了朱元璋一個人控制的秘密武裝力量。知道洪武皇帝朱元璋晚年，大家才知道有這麼一個神秘的組織。當時錦衣衛已經十分完善，人員也已經壯大到可以自成一個軍的地步。朱元璋就把他們劃為一個衛所，他們的首領正式成為上得了檯面的政府官員，指揮使級別不高，但是錦衣衛指揮使的實權絕對不容小視。
第三種戰犯說。據說錦衣衛的前身就敢死隊，也就是一群本來要死的犯人。當時軍閥割據的時候，朱元璋也不過是一個南方的小股勢力。他不但要對付北方的蒙古人，更要和陳友諒、張士誠等人搶地盤。當時由於戰亂和饑荒，各地治安特別的不好，到處都是殺人放火，搶劫的事情幾乎不間斷。朱元璋的軍隊比較守規矩，不但不欺負老百姓，而且還經常幫助當地老百姓。朱元璋曾經下過命令，凡是手下士兵搶劫或者霸佔老百姓財物者，就地格殺絕不容情。但是隨著軍隊士兵人數增加，總有一些人敢於鋌而走險。一些犯了事計程車兵，還有一些地方地痞流氓被集中起來，一起殺頭也是為了殺一儆百。這種事情在當時經常可以看見，每每發生後，地方就會平靜一段時間，不過不久之後又會發生相同的事情。有一次朱元璋親自監斬，殺的是一批因為喝醉了酒做了荒唐事計程車兵。因為打贏了一場大戰，士兵們喝多了酒，幾個人竟然欺負了一個女孩子。老百姓把他們告到了朱元璋的妻子馬秀英那裡，馬秀英毫不容情地把這些士兵抓了起來，並宣佈馬上執行死刑。朱元璋剛好回來，他並沒有阻止妻子，他知道馬秀英做的沒有錯。害群之馬危害很大，會使大量的老百姓和自己離心離德，到時候後悔就晚了。為了表示自己對這件事情的重視，朱元璋親自監斬。沒想到一個將要被斬首計程車兵，竟然求朱元璋答應他一個要求。這個士兵十八歲就跟著朱元璋了，在戰場上生裡死裡奮鬥了好多年。他要求朱元璋讓他死在戰場上，最後為大家做點事情。這個士兵這麼一說，其他計程車兵也說出同樣的要求，就連一些也要被一起殺頭的流氓也這麼說。朱元璋抱著一種試試看的心態，把這些死刑犯編在一個敢死隊裡，讓他們衝在最前面，並囑咐其他計程車兵，他們一旦想逃或者想背叛的話，馬上就地格殺。一場戰役下來這些死刑犯幾乎死了一半，到那會死他們的功勞特別大，他們幾乎都是抱著必死的決心殺敵的。發現這個好處的朱元璋暗中大喜，秘密去牢房試探大家。沒想到絕大多數的罪犯都願意上戰場殺敵。這些人並不是孬種，都是因為一時的衝動才犯了事，這些人已經很後悔了。當他們聽說一旦上了戰場，只要敢於和敵人拼命，殺一個敵人免死罪，殺兩個敵人免於坐牢，殺三個敵人直接免罪的時候，大家都坐了起來。當朱元璋答應大家，殺敵越多獎賞越大，甚至於為他們解決將來生活問題的時候，幾乎所有的罪犯都站了起來。就此這些罪犯搖身一變成為了敢死隊隊員，衝在戰爭的最前沿。建國後朱元璋還是套用這個方法，將一些死刑犯和重犯集中起來，一起洗腦後加以訓練，把他們變成終於他一個人的奴才。這些