懌。於是假為靈太后辭遜之詔。叉遂與太師高陽王雍等輔政，常直禁中，肅宗呼為姨父。
自後專綜機要，鉅細決之，威振於內外，百僚重跡。相州刺史、中山王熙抗表起義，以討叉為名，不果，見誅。叉尋遷衛將軍，餘如故。後靈太后與肅宗宴於西林園，日暮還宮，右衛將軍奚康生復欲圖叉，不克而誅。語在其《傳》。是後，肅宗徙御徽音殿，叉亦入居殿右。既在密近，曲盡佞媚，以承上旨，遂蒙寵信。出入禁中，恆令勇士持刀劍以自先後，公私行止，彌加威防。叉於千秋門外廠下施木闌檻，有時出入，止息其中，腹心防守，以備竊發。人物求見者，遙對之而已。乃封其子亮平原郡開國公，食邑一千戶。及拜，肅宗御南門臨觀，並賜御馬，帛千匹。
初，叉之專政，矯情自飾，勞謙待士，時事得失，頗以關懷，而才術空淺，終無遠致。得志之後，便驕愎，耽酒好色，與奪任情。乃于禁中自作別庫掌握之，寶充牣其中。又曾臥婦人於食輿，以帕覆之，令人輿入禁內，出亦如之。直衛雖知，莫敢言者。輕薄趣勢之徒，以酒色事之，姑姊婦女，朋淫無別。政事怠惰，綱紀不舉，州鎮守宰，多非其人。於是天下遂亂矣。
從劉騰死後，防衛微緩。叉頗亦自寬，時宿於外，每日出遊，留連他邑。靈太后微察知之。叉積習生常，無復虞慮。其所親諫叉，叉又不納。正光五年秋，靈太后對肅宗謂君臣曰：“隔絕我母子，不聽我往來兒間，復何用我為？放我出家，我當永絕人間，修道於嵩高閒居寺。先帝聖鑑，鑑於未然，本營此寺者正為我今日。”欲自下發。肅宗與群臣大懼，叩頭泣涕，殷勤苦請。靈太后聲色甚厲，意殊不回。肅宗乃宿於嘉福殿，積數日，遂與太后密謀圖叉。肅宗內雖圖之，外形彌密，靈太后�真忿之言，欲得往來顯陽之意，皆以告叉。又對叉流涕，敘太后欲出家，憂怖之心，如此密言，日有數四。叉殊不為疑，乃勸肅宗從太后意。於是太后數御顯陽，二宮無復禁礙。
叉舉其親元法僧為徐州刺史，法僧據州反叛。靈太后數以為言，叉深愧悔。丞相、高陽王雍，雖位重於叉，而甚畏憚，欲進言於肅宗，而事無因。會太后與肅宗南遊洛水，雍邀請，車駕遂幸雍第。日晏，肅宗及太后至雍內室，從者莫得而入，遂定圖叉之計。後雍從肅宗朝太后，乃進言曰：“臣不慮天下諸賊，唯慮元叉。何者？叉總握禁旅，兵皆屬之；父率百萬之眾，虎視京西；弟為都督，總三齊之眾。元叉無心則已，若其有心，聖朝將何以抗？叉雖曰不反，誰見其心？而不可不懼。”太后曰：“然。元郎若忠於朝廷而無反心，何故不去此領軍，以餘官輔政？”叉聞之，甚懼，免冠求解。乃以叉為驃騎大將軍、儀同三司、尚書令、侍中、領左右。叉雖去兵權，然總任內外，殊不慮有黜廢之理也。後叉出宿，遂解其侍中。旦欲入宮，門者不納。尋除名為民。
初，咸陽王礻喜以逆見誅，其子樹奔蕭衍，衍封為鄴王。及法僧反叛後，樹遺公卿百僚書曰：
魏室不造，奸豎擅朝，社稷阽危，綴旒非譬。元叉險慝狼戾，人倫不齒，屬籍疏遠，素無問望，特以太后姻婭，早蒙寵擢。曾不懷音，公行反噬，肆茲悖逆，人神同憤。自頃境土所傳，皆雲：叉狼心蠆毒，藉權位而日滋；含忍諂詐，與日月而彌甚。無君之心，非復一日；篡逼之事，旦暮必行。
抑又聞之，夫名以出信，信以制義，山川隱疾，且猶不以名，成師兆亂，巨君不臣，求之史籍，有自來矣。元叉本名夜叉，弟羅實名羅剎，夜叉、羅剎，此鬼食人，非遇黑風，事同飄墜。嗚呼魏境，離此二災！惡木盜泉，不息不飲；勝名梟稱，不入不為。況昆季此名，表能噬物，日露久矣，始信斯言。況乃母后幽辱，繼主蒙塵，釋位揮戈，言謀王室，不在今日，何謂人臣！諸賢或奕世載德，或將相繼踵，或受任累朝，或職居機要，或姻戚匪他，或忠義是秉，俯眉逆手，見制兇威，臣節未申，徒有勤悴。
又聞自叉專政，億兆離德，重以歲時災厲，年年水旱，牛馬殪踣，桑柘焦枯，饑饉相仍，菜色滿道，妖災告譴，人皆嘆息。瀍澗西北，羌戎陸梁；泗汴左右，戍漕流離。加以剖斮忠賢，殲殄宗室，哀彼本邦，一朝橫潰。今既率師，將除君側。區區之懷，庶令冠屨得所，大憝同必誅之戮，魏祀無忽諸之非。
叉為遠近所惡如此。
其後靈太后顧謂侍臣曰：“劉騰、元叉昔邀朕索鐵券，望得不死，朕賴不與。”中書舍人韓子熙曰：“事關殺活，豈計與否？陛下昔雖不與，何解今日不殺？”靈太后憮然。未幾，有人告叉及其弟爪謀反，欲令其黨攻近京諸縣，破市