徐晃平定了益州之後，方雲委劉馥擔任益州刺史，這位從太行山時代就加入方雲軍的老人總算是熬出了頭，以他三十來歲的年紀，以後未必沒有進一步的可能性。
同時徐奕為豫州刺史，劉燁為沛郡太守、婁圭為漢中太守、國淵為徐州治中、顧雍為巴郡太守、管寧為益州治中。華歆、王烈和邴原等人都有提升。
徐晃封為西南軍區總司令，主管西南軍區（益州、南中、西藏和一部分荊南地區）防務；趙黎為華南軍區總司令，主管華南地區（交州，崖州、部分荊南地區和部分揚州地區）防務；黃忠的職位改為華東軍區總司令。主管華東地區（青州、徐州、部分揚州和夷州）防務；陳濤為華中軍區總司令，主管華中地區（兗州、豫州和荊北）防務。
周倉為華北軍區總司令，主管華北地區（冀州、部分幷州、部分幽州和長城外部分地區）的防務；楊鳳為東北軍區總司令，主管東北地區（遼東郡以東以北地區，以後或許會包括島國）防務；張燕為司棣軍區總司令，主管司棣地區的防務；張郃為西北軍區總司令，主管西北地區（部分幷州、雍州、涼州和西域）防務。
方雲承諾那些世家，新佔區實行一國兩制。十年內政治模式不會改變。但軍事的改革，卻不是那些世家可以阻擋的。根據地域的不同。方雲把華夏分為八大軍區，和後世略有不同，不過卻也算是最合理的分配。
各軍區總司令並非永遠都可以在任上，會在六年後進行調整。該上位的上位，該調職的調職，該提拔的提拔。該降職的降職。考慮到華夏本土幾乎已經收復，故而除了華南、西南、東北、西北軍區還保留三到五萬人以上的建制以外，其他地區的兵員各地軍分割槽士卒不超過五百人，總人數也就萬人左右。
益州以南其實還有一個南中地區，那裡的漢人不多。但苗人可不少。曾經讓蜀漢一度頭痛的蠻王孟獲，就是苗人頭領。東漢的時候，雖然也有設定及羈縻州，甚至專門設定州郡治理這些蠻人，但漢人的優越感使得漢人和蠻人的相處並不是非常融洽。
在這些地區，蠻人需要承擔的徭役和賦稅，是漢人的三倍以上，這也是為什麼那麼多越人會躲入山林之中，與漢朝作對的主要原因。
根據方雲的‘歸化令’，不僅僅是士燮那邊開始試驗，在佔領了益州地區之後，徐晃也開始根據方雲的命令，開始試驗‘歸化令’。
方雲也不會虧待了那些願意接受規劃的蠻人，不僅賜予更多的土地，而且無論是做工、經商還是讀書，都有不少的優惠。甚至黃染也在蠻人之中選拔一批人，補充到無當飛軍之中，作為預備役使用。
優渥的待遇，還有平等的地位，使得不少蠻人願意走出深山，接受歸化。當然真正讓他們不得接受歸化的原因，還是‘歸化令’這把達摩克利斯之劍懸在頭頂起了作用。
當五個蠻人部落被突破之後，大部分的蠻人願意接受歸化，反正也沒什麼不好。
如木鹿大王、朵思大王、金環三結、帶來洞主和兀突骨幾位蠻王，最終都在徐晃的兵鋒下選擇投降，放棄當他們的土皇帝。而且本來這些人有不少，都已經透過劉璋的軍官考試，獲得軍官稱號的，如今投效不過是接受整編罷了。
反而是孟獲和他未婚妻祝融夫人兩部蠻人，還有其忙牙長和阿會喃所屬蠻人部落，以南中煙瘴作為天險，打算繼續當他們的土皇帝。
不少不願意接受歸化令，又擔心被滅族的蠻人，都跑去投靠了孟獲。頓時，孟獲的治下至少有十幾萬人，有可戰之兵七八萬人。蠻夷大多以打獵為生，常年與虎豹為伍，故而簡單訓練一下就是不錯的叢林戰精兵。
徐晃把孟獲的情況報告給了方雲，得知孟獲才不過十四歲，而祝融也不過十一歲，方雲無語了，正所謂小孩子氣大概就那麼一回事，年輕氣盛不懂事，為了爭一口氣把全族都歸搭進去，也不知道他們兩個是怎麼當上蠻王的。
於是大手一揮，把黃染暫時調了過去給徐晃，然後調過去大量的醫生和藥物。關鍵是數萬的工兵前往南中地區修橋鋪路，一副要徹底改變南中地貌的姿態。方雲還就不相信了，他這樣暴力把南中地區開發出來，那些鳥獸糞便積壓所形成的煙瘴，還會存在！
到時候一條大道直通對方要害，看他孟獲死不死！
孟獲不過是小問題，有一件事卻又由不得他不注意。那就是華佗和靈力研究所的人，終於研究出瞭如何把宇宙靈氣，吸引到地球的方法。
聚靈陣經過數次改造和研究，研究所終於開發出了一種居心聚靈陣。