和徭役攤派，對於國家的經濟管理和社會穩定起到了一定的作用。雖然從長遠看這種制度限制了人口的流動，但在明朝初期對於國家資源的整合是有貢獻的。
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一.誅殺功臣
- 許多史書都記載了朱元璋晚年大肆誅殺功臣的事件。其中最著名的是胡惟庸案和藍玉案。胡惟庸案持續多年，從洪武十三年（1380年）誅殺胡惟庸開始，朱元璋藉此廢除丞相制度，並且不斷牽連擴大，許多開國功臣如李善長等都被捲入其中。《明史》記載“詞所連及，坐誅者三萬餘人”，可見此案牽涉範圍之廣。
- 藍玉案發生在洪武二十六年（1393年），藍玉是明朝的名將，為明朝的建立和鞏固立下赫赫戰功。但朱元璋因擔心藍玉等武將勢力威脅皇權，以謀反罪將藍玉處死，受此案牽連被殺者多達一萬五千餘人。這些大案使得明朝初期的功臣集團幾乎被一掃而空，朱元璋也因此被認為是猜忌心過重、手段過於殘忍。
二.設立特務機構，政治氛圍緊張
- 朱元璋設立錦衣衛等特務機構，這在史書中多有記載。錦衣衛直接對皇帝負責，他們可以不經過正常的司法程式，就逮捕、審訊臣民。他們暗中監視朝廷官員和百姓的一舉一動，使得朝廷內外人人自危。《明史·刑法志》記載“錦衣衛獄者，世所稱詔獄也。古者獄訟掌於司寇而已。漢武帝始置詔獄二十六所，歷代因革不常。至明初，錦衣衛獄近之，幽系慘酷，害無甚於此者。”這種特務統治使得明朝初期的政治氛圍十分壓抑。
三.八股取士，禁錮思想
- 朱元璋確定了八股取士的科舉制度。規定科舉考試只能從四書五經中命題，考生必須按照固定的格式答題，這種制度被記載為嚴重禁錮了文人的思想。學子們為了科舉成功，只能埋頭於四書五經的背誦和刻板的八股文寫作，而忽視了對實際才能和其他學術思想的追求。這使得明朝的文化發展在一定程度上受到阻礙，思想逐漸僵化。
四.法律嚴苛，易生冤案
- 朱元璋制定的法律雖然在整頓吏治等方面有一定作用，但其中有很多非常嚴苛的刑罰。例如“剝皮實草”這種酷刑，用來懲治貪汙官員。在執行過程中，由於法律的解釋權往往在皇帝和少數官員手中，容易導致冤案的發生。一些無辜的人可能會因為被誣告或者被誤判而遭受殘酷的刑罰，這使得社會上產生了一定的恐慌情緒。
五.經濟政策的侷限性
- 朱元璋推行重農抑商政策。雖然他重視農業發展，但是對商業的抑制在一定程度上阻礙了商品經濟的自然發展。比如商人在社會階層中地位較低，受到諸多限制，如服飾、住行等方面都有嚴格規定，這使得商業活動的活躍度和創新受到壓抑，從長遠來看不利於經濟的多元化發展。
- 他實行的戶籍制度和裡甲制度在強化社會控制的同時，也限制了人口的合理流動。百姓被固定在土地上，難以自由遷徙去尋找更好的經濟機會。這種僵化的制度安排可能導致經濟的區域性停滯，並且在後期隨著社會的發展變化，出現了很多逃避戶籍管理的現象。
六.對外交往相對保守
- 朱元璋在對外政策上總體比較保守。他建立明朝後，實行海禁政策。除了官方允許的朝貢貿易外，民間海上貿易被嚴格禁止。這一政策主要是為了防止沿海居民與海外勢力勾結，鞏固政權安全，但在很大程度上限制了中國與外部世界的經濟文化交流。在當時航海技術逐漸發展的時期，這種做法使得中國失去了一些向外開拓市場、瞭解世界的機會。
七.過度干預文化領域
- 除了八股取士禁錮思想外，朱元璋還對文化領域進行了比較多的直接干預。他對書籍出版、戲劇內容等都有嚴格的審查制度。一些不符合統治階層價值觀或者可能引發對政權不利聯想的內容會被禁止或修改。例如，在編纂史書、文集等過程中，要遵循官方的意識形態，這在一定程度上限制了文化的自由發展和學術的正常交流。
八.土地政策引發的問題
- 朱元璋推行的一些土地政策雖然有積極的一面，但也存在問題。例如，他為了保障國家的賦稅收入和軍隊的供給，實行衛所屯田制度，軍屯土地歸國家所有。在初期，這有利於軍隊自給自足，減輕財政負擔。然而隨著時間推移，軍官侵佔屯田土地的現象頻發，導致大量軍屯土地流失，影響了軍隊的後勤保障，也破壞了原有的土地分配秩序。
- 同時，在土地分配上，皇室和