傑克、艾米麗和湯姆回到自己的世界後，生活看似恢復了往昔的平靜，但他們的內心卻永遠被那一系列驚心動魄的經歷所改變。
傑克開始養成了寫日記的習慣，他試圖把在各個時空所經歷的一切都詳細地記錄下來。每一個夜晚，他都會坐在書桌前，在昏黃的燈光下，翻開那本厚厚的日記本，思緒也隨之飄回到那些充滿危險與奇蹟的時刻。
“今天，當我走在熟悉的街道上，看著周圍平凡的一切，卻難以抑制內心對那個充滿未知時空的思念。我們成功關閉了那個危險的實驗室，拯救了時空，可那些經歷卻像是刻在靈魂深處的印記。”傑克在日記本上認真地寫道。
艾米麗則一頭扎進了對時空相關文獻的研究中。她在圖書館和各種古老的檔案室裡穿梭，尋找著任何可能與他們經歷相關的線索。她知道，雖然他們暫時恢復了時空的平衡，但關於時空的奧秘還有太多太多等待著被揭開。
在一次偶然的查閱中，艾米麗發現了一本古老的文獻。這本文獻的紙張已經泛黃脆弱，上面的字跡也有些模糊不清，但其中一些關於時空能量波動和生物進化的描述卻讓她大為震驚。文獻中提到，曾經有一個傳說中的種族，他們擁有強大的時空穿越能力，並且熱衷於做各種危險的生物實驗，就像他們在那個神秘時空裡所見到的一樣。
“這會不會是那個文明的遺留記錄呢？”艾米麗心中充滿了疑惑。她迫不及待地把這個發現告訴了傑克和湯姆。
湯姆在經歷了那一切後，對做實驗產生了一種複雜的情感。一方面，他深知實驗的危險性，尤其是那些跨越時空界限、違背自然規律的實驗；另一方面，他又覺得透過合理的實驗可以更好地理解時空的奧秘。於是，他開始在自己的小實驗室裡進行一些謹慎的、基於他們所帶回的資料和樣本的研究。
然而，他們的平靜生活並沒有持續太久。一天，傑克收到了一封匿名信。信中只有簡短的一句話：“你們以為真的拯救了時空嗎？這一切不過是個開始。”傑克看著這封信，心中湧起一股不祥的預感。
與此同時，艾米麗在繼續研究那本古老文獻時，發現了一些被隱藏起來的內容。這些內容暗示著，他們所關閉的那個實驗室可能只是一個小小的分支，真正的核心實驗還在另一個隱藏的時空之中，而且那裡正在進行著一個足以毀滅所有時空的終極實驗。
“我們被背叛了！”艾米麗憤怒地說道，“我們以為我們完成了使命，可實際上我們只是被誤導了。”
傑克、艾米麗和湯姆意識到，他們必須再次踏上穿越時空的旅程。這一次，他們面臨的將是更加巨大的危險和未知。
他們根據文獻中的線索，經過一番艱難的準備，終於找到了通往那個隱藏時空的入口。當他們穿越入口時，感受到了一股前所未有的強大能量壓迫感。
這個時空裡，到處都是巨大的能量旋渦和奇異的生物。那些生物看起來比之前見到的更加恐怖和強大，它們的身體散發著一種令人毛骨悚然的氣息。
在探索的過程中，他們發現了一個巨大的實驗基地。這個基地裡的裝置比之前見到的更加先進和複雜，而且到處都充滿了各種危險的能量反應。
他們小心翼翼地潛入基地內部，卻發現這裡有一個熟悉的身影——曾經在他們第一次穿越時空時遇到的一個神秘人物。
“你是誰？為什麼要欺騙我們？”傑克憤怒地質問。
神秘人物冷笑一聲：“你們這些愚蠢的人，你們以為你們能輕易地破壞我們偉大的計劃？我們所做的一切都是為了實現時空的重生，而你們卻一直在阻礙我們。”
“你們所謂的重生是建立在毀滅所有時空的基礎上，這不是真正的重生。”湯姆反駁道。
就在雙方僵持不下的時候，基地內突然發生了一陣劇烈的能量波動。原來是那個終極實驗已經進入了關鍵階段，如果不及時阻止，所有時空都將被捲入一場無法挽回的災難。
傑克他們顧不得與神秘人物糾纏，立刻開始尋找停止實驗的方法。他們在基地裡四處奔波，破解各種複雜的機關和密碼。
在這個過程中，他們多次遭遇危險，幾乎喪命。但憑藉著他們之間的默契和頑強的意志，一次次化險為夷。
終於，他們找到了實驗的核心控制系統。然而，就在他們準備關閉系統的時候，神秘人物再次出現並阻止了他們。
一場激烈的戰鬥在狹小的控制室內展開。傑克他們雖然在人數上佔優勢，但神秘人物卻擁有強大的超能力，一