卻說那日在敦煌城門與眾人作別後，周芷若快馬加鞭趕回峨眉，一路上山風拂面，她心中卻思緒萬千。峨眉山上，弟子們早已等候多時，見掌門歸來，紛紛行禮。周芷若望著這些年輕的面龐，暗自發誓定要將峨眉發揚光大。
此後，她閉關月餘，潛心鑽研敦煌所得武學與經文。峨眉金頂之上，她日夜苦練，那本古樸經書中的梵文要義、武功心法逐漸被她參透。那經文仿若來自西域佛國的智慧密藏，每一個梵文符號都似藏著天地玄機，經她反覆揣摩、以心印法，終與峨眉劍法相融。使得劍法更加凌厲詭譎，兼具剛柔，出招之際，劍勢如虹，隱隱透著一股梵音禪意，讓人防不勝防。
再說葉瀾清，別了眾人後，一路東行。一日，行至一處荒僻山谷，谷中雲霧繚繞，仿若仙境。他正欲穿過山谷尋路，卻見前方山洞中有光芒閃爍。好奇之下，入洞探尋，只見洞壁之上刻滿符文，中央石臺上放著一本秘籍，封皮上書《乾坤混元訣》。葉瀾清心中大喜，知曉這是一場難得機緣。當下，他在洞中盤坐，翻開秘籍研讀起來。
這秘籍所記武功，博大精深，以內力混元為基，招式變幻莫測，能引天地之力為己用。其上文字古奧，仿若上古仙人遺篇，既有道家沖虛圓通之理，又含兵家縱橫捭闔之勢，葉瀾清浸淫其中，日夜不輟。餓了食些野果，渴了飲山泉水，於這山谷靜謐之中，仿若與天地靈氣相通。
數月過去，葉瀾清終將這《乾坤混元訣》初窺門徑。出谷之時，他只覺渾身真氣鼓盪，舉手投足皆有莫大威力。途經西安府，見此地江湖龍蛇混雜，俠義之風不盛，心念一動，便決定留在此地，開創門派。
他尋得一處廢棄道觀，帶領幾位志同道合的江湖豪傑，修葺一新，取名“混元派”。開山收徒，傳授武藝，葉瀾清謹遵俠義為本，所收弟子皆品性純良之人。他將《乾坤混元訣》拆解，由淺入深，化為入門、進階功法，教給弟子。
短短時日，混元派在西安府聲名漸起，常有弟子外出行俠仗義，懲治惡霸。有一回，城中百姓受一夥悍匪欺壓，混元派弟子聞風而動，施展混元功法，以剛猛勁道與靈動身法相結合，不過盞茶功夫，便將悍匪打得落花流水，百姓歡呼雀躍，對混元派讚譽有加。
時光匆匆，數年過去，混元派已頗具規模，成了西安府一武林大派。江湖中，提起葉瀾清之名，亦是人人稱道。而周芷若在峨眉同樣建樹頗豐，峨眉派在她的引領下，重振雄風，弟子武功高強，常為江湖主持公道。
一日，周芷若在峨眉密室整理典籍，偶然翻到一本古籍，其上記載：“倚天劍，上古神兵，若有損，尋烈火精金，配以九陽真火重鑄，方可復原。”看到此處，周芷若心中一動。自靈蛇島刀劍互砍，倚天劍斷裂，雖依舊鋒利，但已成兩截廢鐵，若能重鑄，一代神兵利器“倚天劍”有望復原，成為峨眉鎮派之寶。當下，她安排好門派諸事，啟程前往光明頂。
光明頂之上，昔日明教總壇如今已換了景象。周芷若尋到銳金旗掌旗使吳勁草，說明來意。吳勁草見是周芷若，拱手笑道：“周掌門，多年不見，風采依舊啊。聽聞峨眉在你手中蒸蒸日上，可喜可賀。”周芷若微微點頭：“吳前輩，今日前來，是想諮詢您重鑄倚天劍的事情，我在峨眉典籍找到倚天劍修復之法…”吳勁草撫須道：“這倚天劍乃神兵，重鑄不易，不過既然周掌門所有此想法，吳某還需請示楊教主和張教主定奪。”
其時楊逍代張無忌行使教主權力，他知道周芷若與張無忌已經和解並已成兄妹關係，他這裡自然無話可說，但按照明教程式動用聖火築器是大事，尤其那倚天劍還是當年殘殺過明教不少弟兄的神兵利器，所以還是決定飛鴿傳書請示張無忌。
信中寫道：“張教主臺鑒，今周芷若周掌門前來光明頂，欲重鑄倚天劍。想當年江湖紛爭，倚天劍多有殺傷本教兄弟，本不該舊事重提，如今明教峨眉兩派一心，且今時不同往日。朱元璋那廝，身為明教出身，卻對昔日兄弟過河拆橋，諸多行徑令人心寒。若能重鑄倚天劍，使其重現江湖，一則可震懾宵小，二來也可作為一種警示，望教主斟酌。”
在這等待期間，周芷若與楊逍交流了諸多事情。楊逍將信中詳情告知芷若，談及朱元璋近年所作所為，擴充勢力後對明教舊部打壓排擠，諸多兄弟敢怒不敢言。周芷若聽後，蛾眉微蹙，暗暗嘆息江湖詭譎，人心難測。
恰在此時，光明頂議事廳中，幾位明教高手正在談論江湖諸事。“聽聞那西安府出了個葉瀾清，創立混元派，數年之間，將門派打理得風生水起，門下弟子個