但在弘光朝廷，黃蜚曾和黃得功一起擊敗左夢庚。在黃得功戰死之後，獨自率兩萬人東下抗清，轉戰江南。
堅持到第二年，黃蜚戰敗。先把妻子一門三十餘人沉水，接著自己欲跳入水中意圖自殺。
但清軍用抓鉤將黃蜚撈上岸，為避免他再次自殺，直接弄斷了他的左臂。
黃蜚被綁至南京，見到洪承疇，右手指著他大聲叫罵。
清軍又把他右臂折斷，但黃蜚依舊叫罵不止。最後清軍又割了他的舌頭，嘴裡混雜著鮮血照樣呢喃不停。
最後，黃蜚被斬於南京水西門外。
在南明那個屈辱的時代，黃蜚以自己的行為告訴天下人我華夏男兒從來不缺血性和骨氣。
看著黃蜚，朱由哲眼圈微紅，“黃將軍，可飲酒否？”
黃蜚抱拳，“陛下賜酒，黃蜚當飲。”
朱由哲站起來，親自捧杯走到他身旁，“將軍，請！”
黃蜚端起一飲而盡，抱拳道：“謝陛下！”
朱由哲點了點頭，也讓他坐到了自己身旁。
來曹州之前，朱由哲曾派人去通知朱聿鍵和朱以海前來。
朱聿鍵被朱由哲派去睢陽充當監軍，手中有一些兵卒，所以相對比較自由，得令後就直接來了。
而朱以海是藩王，又沒有特別的待遇。當得知天子召見後，還是在曹縣，吃了一驚，但不敢輕易離開封地，更不敢相信。
於是上報給濟寧知府，濟寧知府也不敢做決定。
黃蜚這個水師提督管理的範圍很大，包括關、遼、通、津、淮海江鎮等地，此時恰在濟寧。
最後，就知道了此事。
當即決定，帶兩千精卒，和朱以海一起緊急前來曹縣。
一是護送朱以海，二是他實在擔心崇禎皇帝會在曹縣出現什麼意外。畢竟，劉澤清可不是什麼良善之輩。
此刻看崇禎皇帝不但沒事，還弄死了劉澤清，黃蜚擔心的心徹底放下，看向崇禎皇帝的眼神裡也滿是佩服。
這時，陳潛夫卻上前一步，“陛下，臣也想飲一杯酒。”
方正化在旁怒聲斥道：“小子無禮，還不速速退下？”
朱由哲擺手制止了方正化，笑道：“當今亂世，君子但求大節，不論小過，可是你說的？”