空陣地也遭到了打擊，數量眾多的導彈在10分鐘之內摧毀了中國空軍在舟山島上的5處防空陣地，至少有4個防空導彈營遭到了毀滅性的打擊。比較幸運的是，中國早已經知道了日本將襲擊舟山島，甚至已經知道了日本具體的偷襲時間，所以在日本發動攻擊前一個小時，所有人員都疏散了。包括港口人員在內，日本的這次偷襲並沒有造成多大的人員傷亡！
4點40分，第一發導彈命中了港內偽裝成“黑龍江”號的那艘油輪，然後在5分鐘的時間內，至少12發導彈命中了這艘倒黴的油船，隨後，在15分鐘之內，油船就沉沒了！
在接下來的1個小時之內，因為舟山島上的防空系統遭到了嚴重的破壞，而且中國的防空戰鬥機只能夠從本土機場起飛，已經趕不及攔截日本的第2攻擊波了。舟山港遭到了非常嚴重的打擊，雖然各巡洋艦與驅逐艦已經開始疏散，並且用戰艦上的防空系統為港口提供掩護，但是這種被動的防禦效果並不是很大，在很短的時間之內，港口設施遭到了毀滅性的破壞，同時，數十艘戰艦遭到打擊！
巡洋艦與驅逐艦都沒有戰列艦那樣的防禦裝甲，在面對這些日本導彈的時候，防禦能力顯得非常的弱小。只要有一枚導彈命中，那麼整艘戰艦的作戰系統都將遭到破壞，甚至是沉沒！
5點15分，日本已經確定了兩個攻擊波的戰果，但是很明顯，還需要派出第三支攻擊波，因為中國的航母�