這時，海德里希猛然發現路旁突然鑽出個人來舉槍對自己射擊，便一邊急忙掏出槍來準備還擊，一邊命令司機立即停車。狂妄自大的海德里希憤怒極了，他連想都沒有多想就從座位上站了起來，然後倚靠在車前的玻璃後面朝加比希克開槍。
庫比斯一見加比希克的槍卡殼了，就立刻從隱蔽的地方衝了出來，從懷裡掏出了那顆有毒的手榴彈，用力把它朝海德里希的汽車扔了過來。隨著一聲巨響，汽車的玻璃被炸了個粉碎，在一片滾滾濃煙中，海德里希受傷了，那些致命的彈片和玻璃屑嵌進了海德里希的身體。
海德里希和司機從車上跳了下來，想繼續追殺那兩位刺客，但是由於傷勢過重，海德里希還沒走多遠就不得不待在原地動不了了，他痛苦地呻吟著。庫比斯和加比希克這時已經消失在公路的轉彎處。
槍聲驚動了一隊路過此地的德軍巡邏隊，他們把海德里希送到了醫院。到了醫院以後，醫生髮現海德里希的胸部和腹部多處被彈片擊中。〖：。。〗
捷克第一流的外科醫生霍爾鮑姆主刀，為海德里希做了手術。手術比較成功，傷勢也似乎向好的方向發展。醫生幫他從體內取出了好幾塊彈片和玻璃屑，並且清洗了幾處傷口。包紮好了後，醫生們認為海德里希的傷勢並不怎麼嚴重。
但是到了第二天晚上，海德里希的傷勢發生了讓醫生們沒有預料到的變化。海德里希感到周身不適，呼吸極度虛弱，面板乾燥，目光呆滯，瞳孔散大，視覺模糊，口乾舌燥，漸漸出現眩暈，所有的傷口都化膿了……又過了兩天，他的傷情進一步惡化，出現進行性肌肉無力，伴有面部麻痺以及四