倆同樣來自現代的危險人物留在身邊。
管志和韓海欣然領命，兩年的時間用來搞步槍，簡直太他媽的容易了。兩人都去警校深造過，槍械的設計圖沒少看到，這種普通玩藝已經算不上什麼絕密檔案。在接下這事關他們腦袋的工作的同時，二人還厚著臉皮跟朱雲天討價還價：“到時把槍搞出來，必須一次付給我們五十萬兩銀子的獎金，否則你現在就可以殺了我們。”
他們清楚自己的價值，朱雲天在得不到想要的東西之前，不會殺他們。所以這個鉅額獎金的要求馬上得到了承諾。朱雲天為了證明自己的誠意，立書畫押為證。
這個時候，鬱郁不得志的呂四通因為某個誰都說不清的原因，突然患了急病死掉了。第一個發現他屍體的是劉天華，據他說，當時他到呂四通的寢帳去找酒喝，卻看到這姓呂的趴在被窩裡一動不動，太陽都照屁股了還沒起床，於是過去掀開一看，方才知道他已經死了大半天。
這事在軍內傳開以後，產生了三種觀點，大部分人認為，呂四通自從在大帥面前失寵之後，確實心灰意冷，害怕大帥找機會懲罰他，吃不進飯，喝不下水，時間一長，天氣一冷就得了怪病不治而亡。從邏輯上講，這個推斷合情合理，怪不得大帥，只能怪呂四通本人不長進。第二個觀點，是一少部分訊息靈通的兵士，這些人負責共和軍高層領導的保衛工作，還有的是為高層領導端茶倒水的勤務兵，他們私下裡認為，呂四通絕對是劉天華給弄死的，你想啊，姓劉的是直屬於作戰部隊的一名營長，跟呂四通關係一般，甚至從未說過話，憑白無故的怎麼會去他那裡找酒喝呢？而且當時是清晨，共和軍制度嚴厲，哪有大清早允許姓劉的到處找酒喝的道理？所以呂四通肯定跟劉天華背地裡有什麼仇恨，姓劉的趁他被大帥冷遇之際，藉機做掉了他，可謂天衣無縫。
以上兩種觀點，在共和軍的下層士兵那裡得到了廣泛的認可，但還有第三種觀點裝在那些軍官的心裡沒有說出來：呂四通是被大帥給弄死的，然後大帥暗中指派劉天華去做為屍體的發現者，以此舉動向這些軍官們暗示姓呂的是因為有過背叛大帥的行為，所以早晚逃不過他的毒手。至於是毒殺還是什麼殺，已經不重要了。重要的是老大對每一名忠心耿耿的下屬都待遇不菲，但對試圖背叛他的人絕對不會心慈手軟。
呂四通事件給了共和軍的所有軍官一個心理上的警告。接著，整個軍隊內部的領導制度進行了一次重整。朱雲天宣佈，共和軍作戰部隊分為四個上下級單位，分別為軍、師、團、營，撤消以前的班級戰鬥單位。這是因為在實戰中，只有十幾人的班起不到什麼效果，而且非常容易單獨為戰，搞小幫派。整個共和軍目前暫時劃分為六個軍，每個軍五萬人，每一萬人為一個帥，師下面的團長與營長在作戰中沒有固定的統兵權，只相當於戰將的作用，具體如何分派指揮，由上面的師長隨機應變。這六個軍的所有兵力，統一歸作戰部領導。李虎除擔任作戰部的參謀長以外，還將擔任第一軍的軍長，劉子軒離開後勤保障部，為隨軍參謀（對他來說，這是天大之喜，標誌著朱雲天對他的重新信任）；徐達仍為作戰部的部長，同時兼任第二軍的軍長，原睢山鐵軍以及彭早住的降軍全部併入第二軍，這也是共和軍最精銳的一支作戰部隊，湯和為隨軍參謀，同時吳氏兄弟亦歸入第二軍作為營長一職；劉天華升任為第三軍的軍長（有人私下認為是因為劉天華幫老大幹掉了呂四通，這個軍長就是獎賞），馮國用為隨軍參謀；陳天畢經過一系列的考察，升為第四軍的軍長，馮國勝為隨軍參謀；唐勝宗為第五軍的軍長，這名虎將一步步的歷練，朱雲天對他暗自觀察了一年多，最終認定他為人可靠，能力超強，特別是馬上功夫，即便是徐達亦難勝他。同時，為了更好的監督他，號稱共和軍內耳目最廣的王國正擔任他的隨軍參謀；第六軍就是共和軍的支援部隊了，為了滿足自己從小就超喜歡炮兵的心願，朱雲天把第六軍正式命名為炮兵部隊，自己親自兼任軍長，圖龍為自己的作戰參謀。
蒙將水裡率領的二十萬蒙軍被劃分在外，沒有列入整個共和軍的建制。對於蒙古將領，雖然水裡是朱雲天一手提拔起來的，但為了避嫌，尤其是生怕在軍內引起漢人軍官的不滿，朱雲天還是謹慎為上，暫且把蒙軍列為了共和軍的地方部隊，由他親自指揮。
對於這一點，朱雲天早跟水裡私下做了交待。已經發誓要永遠效忠朱雲天的水裡非常理解老大的苦心，他跪在地上，割發為誓：“從今往後，我這條命就是大帥您的，您就把我當成一個漢人，當成您的親兄弟！”言外之意，哪怕讓我