瓦爾，身為帝國軍人三男的久城一彌，與在圖書館塔最上方，埋在南國樹木與難解書籍當中的不可思議少女維多利加。自從兩人相遇、建立友誼之後，學園裡的許多秘密接連解開。
兩人首先踏上圍繞著神秘留學生艾薇兒？布萊德利以及寫有怪異咒術的推理與冒險之旅。但是，那又是別的故事了——
第二章 樓梯的第十三階發生不詳之事
黑暗——
空氣十分乾燥。
有如剛從野地摘回來，沾滿夜露的櫻草花束在黑暗之中搖曳。
身穿中世紀騎土裝扮的年輕男子把櫻草抱在胸前，靜靜呼吸。
彷佛嘆息的聲音流漏而出。
“永、遠——”
聲音越來越小。
“和、你、在、一、起。”
生氣好像被這句話吸走，失去色澤的櫻草花逐漸枯萎。
他位在有如地下室的場所，與沒有燈火的絕望關在一起。一動也不動的騎士胞著花束靜靜呼吸。
沒有其他的聲音。
最後那個聲音再度重複一次。
“——永和你在一起。”
漫長的歲月流逝
1
和煦的春日午後。
聖瑪格麗特大圖書館——
直聳入天的角柱高塔。整面牆壁都是巨大書架的挑高大廳，與稍為溼潤、只能說是書香氣息的空氣。
這裡是人稱西歐小巨人的蘇瓦爾王國的山中名校，聖瑪格麗特學園自豪的建築物之一。據說是當時的國王為了和情婦秘密幽會故意蓋得好像迷宮，漫長的迷宮樓梯直達天際
就在接近大圖書館天花板之處，有個被天窗射入的光線照亮，綠意盎然的奇異植物園。那裡升起一縷細細白煙。
陶製的白色菸斗。以綠色眼眸凝視菸斗飄出的輕煙，沉溺於思考當中的人，是有著令人誤認為陶瓷娃娃的外表，美貌又嬌小的少女。
美麗的金色長髮，有如解開的天鵝絨頭巾般瀉落在地上。絲絨粉色緞帶綁在似乎隨時可能折斷的纖細背上，有如交錯的小鳥翅膀往下垂。套著白色鏤空蕾絲做出層層蓬鬆效果的奢華洋裝的大腿上，放著一本攤開的厚重書籍。
攤開的書呈放射狀擺在少女周圍，不知為何還散落著粉紅色MACARON。
——少女突然動了起來。
圖書館入口釘有黃銅柳釘、包覆皮革的推門被人用力推開，發出有人進入的聲音。
少女從扶手間隔探頭向下望，輕輕蹙眉。
淡綠色的少