聯合艦隊為二個以上艦隊編成的日本海軍中心部隊。明治初期，海軍把有力艦・；新銳艦編成主力部隊“常備艦隊”，老朽艦編成沿岸防備的二線部隊“警備艦隊”。但是，由於日清戰爭開戰，提出了“警備艦隊”與“常備艦隊”的統合方案，當時的軍令部官房主事山本權兵衛大佐提出把“警備艦隊”改名為“西海艦隊”、“常備艦隊”與“西海艦隊”組織成“聯合艦隊”的提案。這是聯合艦隊的開始。
到日清戰爭開戰的六日後完成編成。以後日俄戰爭之際再於戰時臨時編成，大正12年（1923年）以後為常設。
聯合艦隊由日本天皇直屬的聯合艦隊司令長官統領，軍令相關由軍令部總長、軍政相關由海軍大臣指示。昭和19年（1944年）的萊特灣海戰之後名存實亡。
聯合艦隊司令部、包括司令長官與補佐幕僚、參謀長、參謀副長（S19～）、首席參謀（通稱先任參謀）、炮術參謀、水雷參謀、航空參謀、通訊參謀、航海參謀、機關參謀、戰務參謀、政務參謀、主計長、軍醫長、機關長、暗號長、氣象長、副官等配置。除首席參謀以外，皆以○○參謀通稱。
戰史
聯合艦隊旗艦出擊的海戰。
甲午戰爭
黃海海戰 （1894年）（明治27年（1894年）9月17日）－旗艦：防護巡洋艦 松島
威海衛海戰（明治28年（1895年）2月12日終結）－旗艦：防護巡洋艦 松島
日俄戰爭
黃海海戰 （1904年）（明治37年（1904年）8月10日）－旗艦：戰艦 三笠
日本海海戰（明治38年（1905年）5月27；28日）－旗艦：戰艦 三笠
太平洋戰爭（大東亞戰爭）
中途島海戰（昭和17年（1942年）6月5～7日）－旗艦：戰艦 大和
歷代旗艦
大和號防護巡洋艦“松島”
戰艦“三笠”
戰艦“敷島”
戰艦“朝日”
戰艦“金剛”
戰艦“山城”
戰艦“長門”
戰艦“陸奧”
戰艦“大和”
戰艦“武藏”
輕巡洋艦“大澱”
歷代司令長官：
代 姓名 就任時軍階 就任年月日
1 伊東祐亨 中將 明治27年（1894年）7月19日
2 有地品之允 中將 明治28年（1895年）5月11日
3 東鄉平八郎 中將 明治36年（1903年）12月28日
4 東鄉平八郎 大將 明治38年（1905年）6月14日
5 伊集院五郎 中將 明治41年（1908年）10月8日
6 吉松茂太郎 中將 大正4年（1915年）11月1日
7 吉松茂太郎 中將 大正5年（1916年）9月1日
8 吉松茂太郎 大將 大正6年（1917年）10月1日
9 山下源太郎 大將 大正7年（1918年）9月1日
10 山下源太郎 大將 大正8年（1919年）6月1日
11 山屋他人 大將 大正9年（1920年）5月1日
12 栃內曾次郎 大將 大正9年（1920年）8月24日
13 栃內曾次郎 大將 大正10年（1921年）5月1日
14 竹下勇 中將 大正11年（1922年）12月1日
15 鈴木貫太郎 大將 大正13年（1924年）1月27日
16 岡田啟介 大將 大正13年（1924年）12月1日
17 加藤寛治 中將 大正15年（1926年）12月10日
18 谷口尚真 大將 昭和3年（1928年）12月10日
19 山本英輔 中將 昭和4年（1929年）11月11日
20 小林躋造 中將 昭和6年（1931年）12月1日
21 末次信正 中將 昭和8年（1933年）11月15日
22 高橋三吉 中將 昭和9年（1934年）11月15日
23 米內光政 中將 昭和11年（1936年）12月1