2月14日，劉伯承回到南京。根據中共中央的指示，召開軍事學院第一次黨員代表大會，宗旨就是“把黨中央提出的總路線、七屆四中全會決議、全軍高幹會議決議貫徹到訓練工作中，完成培養德才兼備的幹部的任務。”
當時，在學員中存在的主要問題仍然是驕傲自滿、功臣自居和狹隘經驗主義。軍事學院黨委曾經在精簡整編、三反、整黨、提高與普及軍事科學思想教育等運動中多次進行整頓。
黨代會期間，劉伯承又花了很大氣力解決這些問題。他給海軍、空軍、炮兵和裝甲兵四系學員，給全院黨員幹部，給全體教職員工，作了一次又一次報告，宣傳黨在過渡時期的總路線，宣傳黨的七屆四中全會關於增強團結的決議。同時，嚴肅指出驕傲自滿如不克服而任其發展的嚴重危害：從驕傲開始到“驕隋”，學習、工作賴得去幹，甘當思想懶漢；其次到”驕奢”，貪汙腐化，忘記了人民群眾的利益，忘記了油、鹽、柴、米的價錢；再次到“驕橫”，個人居於黨之上，把自己領導的地區或部門看成是“獨立王國”，最後走上反對黨、分裂黨的危險道路。
各個學員系根據劉伯承的報告，普遍進行了一次思想整頓，借高、饒事件的教訓檢查清理驕傲自滿的各種表現，並重點批評教育了一些人員。最後，劉伯承拿著一大棵整頓的總結材料，在全院大會上高興地說：“好。這才是馬列主義。各路諸侯來到軍事學院，都講自己如何過五關斬六將，這不行。
高崗就是因為驕傲、有野心，才犯了錯誤。黨中央是核心，我們都要團結在黨中央周圍。”
這一次思想整頓，對全體學員教育很大。特別是對即將結業的基本系和情報系第一期學員，教育就更為深刻。
基本系和情報系是完成系。第一期學員從1951年1月入學，到1954年的3月，所學課程全部結束，進入畢業考試階段。
3月下旬，中央軍委任命朱德為主席，劉伯承和總政治部副主任甘泗淇等為副主席，組成國家考試委員會，對軍事學院畢業學員進行嚴格的考核驗收。
所謂國家考試，就是由國家統一命題，由中央軍委、總部領導任主考官，對畢業學員實施軍事（理論與想定）、政治課程的考核。軍事理論考試主要是口試，軍事想定則進行圖上作業。口試的方法是抽籤答題，即把試題寫在試題簽上，放在試題盒內。應考學員可以從盒內任抽一簽，根據簽上的試題準備10至15分鐘時間，然後對主考官作出回答。除了試題簽上的試題之外，主考官還可以提出其他有關問題，學員也必須作出回答。最後，由考試委員會按5級分制評定考試成績。
3月25日，甘泗淇來到軍事學院，首先主持了政治理論國家考試。接著，學員們又進行了軍事想定作業的國家考試。
4月19日，朱德來到軍事學院，親自主持基本系、情報系第一期軍事理論國家考試。
對於朱德的到來，劉伯承心裡十分高興。在長期的革命戰爭中，兩人相知相親，友情甚篤。劉伯承對朱德一向十分敬重和愛護。在一次涉外招待宴會上，一些外賓和外國軍官，出於對朱德的敬佩，爭先恐後向朱德敬酒，弄得朱德不勝招架。劉伯承主動上前應酬，代替朱德把外賓的敬酒左一杯、右一杯都喝了。他本來不會喝酒，一下喝了這麼多，結果宴會一散就虛脫了。
第二天，秘書和警衛員都埋怨他不會喝酒不該“逞強”。他卻幽默地說：“你們知道啥子嘛！我這是代朱老總領功，替朱老總受獎，是很光榮的囉！不然的話，朱老總可就承受不住嘞！”
這次，他親自帶領學院的領導，到下關輪渡碼頭迎接朱德，陪同朱德檢閱了由學員組成的陸、海、空三軍儀仗隊。儀仗隊軍容嚴整、軍威雄壯，受到朱德的高度讚揚。
第二天，劉伯承又陪同朱德視察了軍兵種教授會的專修室。專修室佈置一新，整潔明亮。牆上掛著一些兵器的照片、圖表；地上放著這些兵器的實物或模型；桌子上擺著沙盤和其他教具等。朱德饒有興趣地看著牆上的照片和圖表，指點著一些兵器，和他愉快地交談著。他告訴朱德，這種專修室每個教授會都有一個，全院共有幾十個，為教學和學術研究提供了方便。朱德稱讚專修室建得好，並建議內容要不斷更新，不斷充實；要把它們充分利用起來，為教學和學術研究服務。
4月25日，基本系和情報系進行最後一門軍事理論的國家考試。考場所在的大樓佈置得煥然一新。外牆正中懸掛著一顆金色的國徽，兩邊垂放著大幅標語，一邊寫著“國家考試就是我們