乾隆開始下詔徵書時，全國各地藏書家由於驚恐清代所搞的文字獄，而遲遲不敢進獻典籍。
揚州馬裕家，據悉“藏書頗富”。但是，當兩淮鹽政李質穎奉旨前去取書時，馬氏只呈報195種。乾隆得知此情後，諭軍機大臣：“馬裕家，夙稱善於收藏，何所存僅止於此，必系地方官員採辦不妥，其家未免心存畏懼，遂憚將善遠匿，故所開書目不精不備。著撫鹽政，善為詢覓，務祈多多益善。”後來，馬裕見隱匿不得，又感皇上之情切，呈報進獻書達五六百種，遂一炮打響。浙江飽士恭、範懋柱、江啟淑等藏書家，均遵旨奉書，“願以家藏舊書，上充秘府”。據此，乾隆帝又施行一種獎勵辦法。首先，以獻書較多的馬裕、飽士恭、範懋柱、江啟淑四家為例，各賞《古今圖書整合》一部；繼而，給獻書百種以上的周原育、蔣曾蓉、吳玉墀、紀昀、汪加藻等，各賞《佩文韻府》一部。乾隆聽說獻書最多的浙江寧波範懋柱家的藏書樓稱“天一閣”，其建築全用磚瓦石灰，因而無畏火燭。於是，便以關懷為名，派官員寅著去天一閣考究，以效仿其建築方法，以利藏書。
乾隆還在詔書中曰：“所進呈之書，繕抄或錄副後，即發還原書。”
其實，這些都是在說謊。
當時，浙江巡撫三寶，從範懋柱家提去不少世間孤本藏書，據四庫提要及浙江採辦官員統計，共有638種。但是，《四庫全書》告竣後，並未有發還原書。範氏的“天一閣”藏書樓，只不過是多了一部御賜毛裝《古今圖書整合》。其效果，只是起到一些裝璜門面罷了，還得日日焚香供奉，著實添了許多麻煩。
其原書，有許多被翰林院學士和參加纂修《四庫全書》的官員帶回家中，成為私有。更有的流入廠肆，已無法找到。
藏書家失去書，甚為痛苦，更有因痛苦而致死者。
乾隆所以放縱這樣做，他還有一個原因。那就是透過編纂《四庫全書》，對全國藏書進行一次刪削、修改、掃蕩。原來，滿洲族在清太宗皇太極前，稱為建州女真。後金天聰九年（1635年），皇太極改女真族為滿洲族。在滿清進入中原、定鼎北京前，明代的書籍中稱其為“建州奴酋”或“建州夷部”，多有汙衊、抵毀之詞。透過這次纂修，進行一次全面刪改。對於那些認為是詞意牴觸的“違礙”、“狂悖”之書，大量禁絕和焚燬。