在火車站遭行刺重傷。被送進醫院後，22日逝世。全國震動，力促追兇。南方革命人士更是群情激憤。袁亦發表宣告，表示可惜，督令全力追查；電江蘇都督程德全負責偵緝：「務得確情，按法嚴辦」。翌日有人投報是應夔承買兇。旋由英法捕房抓兇犯武士英，並同時至應宅內搜出了一批有關物證。此後謠言滿天，輿論轉移，又傳是國民黨爭權內鬥所致。
4月8日，第一屆國會在北京召開。到會議員682人。其中參議員179人，眾議員503人。其後選出參眾兩院正副議長。國民黨議員只討論追兇，彷佛因為宋教仁死了，誰當總理組閣不重要。新國會宣佈取代臨時參議院。書包 網 。 想看書來
第1章，第4節：二次革命，全盤失敗
陳天璇《中國歷史何其易下編》現代史
第1章，第4節：二次革命，全盤失敗
第1章，第4節：
二次革命，全盤失敗
孫中山在得知宋教仁被刺殺後即從日本回上海。1913年3月25日抵達，與眾研究對策。
其時，距宋死才三日。但是，上海英法捕房已根據線報，於23日搜獲買兇者應夔承，又於24日抓捕了開槍兇犯武士英，並於同日在應宅內找到一批發自北京政府總理趙秉鈞秘書與買兇者應夔承的密碼通電，以及與此有關的譯碼冊，足證是趙秉鈞在指使，背後主謀當是袁世凱。這才使國民黨內特別是孫中山與黃興這兩位領導人認清袁的面目。於3月底，孫以「國會乃口舌之爭，法律無抵抗之力」，決計興兵倒袁，進行二次革命。但是，國民黨內的帶兵者黃興卻對武力討袁沒有信心，反而主張依循法律解決。那是因為，黃原本曾一度直接統領的革命軍，已於前一年在南京時全數解散了。若要短期內重組，他認為是不可能。與此同時，謠言四起，外界傳出國民黨正內鬨。
其實由同盟會改組後的國民黨，竟連袁世凱的親信都吸收成為會員。由於品流複雜，早已四分五裂。甚至原本南方各省傾向於革命的都督，也有個別私謀，跡近同床異夢。
所以，對於如何倒袁，行動無法統一。而又，國民黨雖然在國會選舉大勝，但是在宋教仁被暗殺後，其欲推行的責任內閣制，無人接替，胎死腹中。部份史家認為，其中主要關鍵在於國民黨為了只謀票數而過份擴大，放棄原同盟會時候較為進步的革命政綱，吸收了太多立憲派和舊官僚份子加入，結果，不是那些人依附國民黨，竟似革命黨倒跟那些人。那時的內閣亦曾謔稱「國民黨內閣」。
但是，4月24日兇手武士英竟然在獄中無故暴斃。隨即，各方追究根由，嚴責當地官員。江蘇都督程德全等人為求表明他們已經盡全力，決定把搜出的證件，包括殺人手槍、有關的密電碼、買兇人與北京有關方面的往來函電等，全部涉案罪證檔案共四十四件，於25日分別電給袁世凱、參眾兩院、國務院、各省都督、民政長、及各報館。至26日起，各報相繼刊出，全國閱後譁然。至此宋教仁被殺的真相大白，背後主謀顯然直指向袁世凱。於是孫黃二人聯名通電，要求「嚴究主名，同伸公憤」。然而在具體行動上，國民黨內部仍議而不決，意見分歧。
史家認為，宋教仁被殺的背後原因是袁世凱欲自己掌實權，不容國會今後走向責任內閣，並將他作為架空的虛銜總統。況且，袁的如意算盤是要最終復辟當皇帝。
另外，就在宋教仁案罪證公佈於世的同一天，袁世凱與英法德日俄五國銀行團簽約，名曰「善後借款合同」，取得了二千五百萬英磅，規定年息五厘，四十七年還清，以中國鹽務全部收入作抵押，亦即自此讓這五國控制鹽政。
對此，國民黨在國會的議員們紛紛反對。他們表示，這項貸款，未經國會同意；是不合法，不能承認。同時由革命黨人擔任的省都督也向全國通電，指此舉為違法借款。
袁其實一方面以此項貸款去擴充其北洋軍，準備以武力來最終消滅革命軍人勢力。又，另方面，袁授意黎元洪儘快籌組織「進步黨」，把原來的共和黨、統一黨、*黨合併為一，在國會內與國民黨進行對抗，務要全力阻止黃興所主張的所謂合法鬥爭。
5月29日進步黨宣告成立，以黎為理事長，實梁啟超主持，有舊時同盟會人士參加，如孫武、伍廷芳等。但此際他們已變成擁袁聯盟，與國民黨在國會內針鋒相對。
至6月初，袁世凱進一步開始先發制人，他下令撤南方三省都督職務。其理由是，江西都督李烈鈞、安徽都督柏文蔚、及廣東都督胡漢民這三人，曾經通電